神秘女子池波女士尋找的中學(xué)同學(xué)柴田手里握著照片被殺，小五郎等開始向相關(guān)者訊問而柯南也弄明白了柴田手握照片的含義。“沉睡的小五郎”當(dāng)眾點破了池波女士的眾多謊言但卻判斷兇手另有其人。而兇手留下的鐵證就留在罪犯的手上，鐵證面前犯人最終承認(rèn)了罪行，但在犯人準(zhǔn)備自我了結(jié)的時候被池波攔下，而池波女士的身份也最終揭曉。

宇佐美過去曾殺害過被害者的孩子。而喝醉酒的宇佐美對事件記憶不清，這樣為案件辯護(hù)的英理看來沒有勝望。小五郎雖是想證明宇佐美的不在場證明，卻作為檢察官方面的證人出庭。對疑點懷有疑問的柯南讓小五郎作為辯護(hù)方證人再次出庭，進(jìn)行了新的推理最終指出了犯人的真實身份。美真治的嫌疑終被洗清。

深夜大地震，帝丹神社的秦錢被落下的鐘壓下而死亡。次日早晨開始調(diào)查，但是事情好象并不那么簡單。柯南他們開始在鎮(zhèn)子內(nèi)搜索。發(fā)現(xiàn)死者房間中頭部留出的血沾染的竹桿。可能是地震之后回房時遭遇不測。在高木警官即將放棄的時刻受到柯南假扮的暮目警官的鼓勵重新振作起來查案。經(jīng)過分下調(diào)查高木警官揭開了事情的真相。

小蘭發(fā)現(xiàn)“影秋村”的村長船木也被殺害。柯南發(fā)現(xiàn)矢部賬戶每月固定打入的匯款，在詢問了駒井關(guān)于7年的事故之后確定了這次的殺人事件與七年前BONNET公交車發(fā)生的事故有關(guān)。在拜托教授調(diào)查了事故之后柯南發(fā)現(xiàn)兇手的身份并發(fā)現(xiàn)兇手欲重演悲劇，他獨自登上觀光車與犯人對峙阻止了悲劇的發(fā)生。

柯南等也到同一個餐廳吃飯，聽說與這幾個漁夫相約的人在海邊溺死了。伊豆海邊發(fā)生了殺人事件。柯南已經(jīng)確認(rèn)了犯人的真實身份并利用因為泡到海水里無法確定死亡時間這個baga套出了犯人的話，面對現(xiàn)實，犯人最終承認(rèn)了自己的罪行。因為殺死了自己的父親而懷恨在心，最終痛下殺手。但自己的這番行為卻得不到同伴的贊同發(fā)怒的兇手最終在小蘭的話語中認(rèn)識到自己的錯誤。