夜晚園子心血來(lái)潮帶著小蘭和柯南來(lái)公園里觀賞銀河，不料卻在花壇里發(fā)現(xiàn)了一起行兇案。園子透過(guò)望遠(yuǎn)鏡看到了一雙女子的手，她手上的戒指正在被兇手摘下，園子過(guò)于震驚沒(méi)有看到兇手的長(zhǎng)相。之后園子大概確定了行兇案的方向，帶著小蘭和柯南組成女高中生偵探團(tuán)去破解這樁行兇案。

柯南從無(wú)人機(jī)上墜落后便失去了犯人的線(xiàn)索，就在眾人一籌莫展的時(shí)候佐藤警官打來(lái)電話(huà)，她稱(chēng)發(fā)現(xiàn)了犯人。佐藤警官上前拘捕犯人卻反被挾持，柯南和高木等人趕到后協(xié)力制服了犯人，但手提包內(nèi)的1億日元卻不翼而飛。另一方面，本該被綁架的麻奈美小姐正在美術(shù)館欣賞裕之的作品，而這背后到底是誰(shuí)在搞鬼？

喜歡刁難人的管理員并沒(méi)有告訴由美等人過(guò)多的線(xiàn)索，柯南結(jié)合能夠得到的信息一步步推敲終于有了結(jié)果，輸入密碼后筆記本電腦只是切換到了前置鏡頭，而那封裝有結(jié)婚登記表的信封早已被管理員塞回了由美的上衣口袋里。就在眾人打算去比賽會(huì)場(chǎng)時(shí)秀吉打來(lái)了電話(huà)，他告訴由美可以丟掉信封，因?yàn)樾氖轮刂氐乃呀?jīng)輸?shù)袅吮荣悺?/p>

平次與和葉邀請(qǐng)小蘭和柯南一起去看彩燈，在等小蘭與和葉準(zhǔn)備晚飯的期間，平次和柯南去樓下的白羅咖啡館打發(fā)時(shí)間，不料卻恰好遇到了一起殺人未遂的案件。受害者雖沒(méi)有生命危險(xiǎn)，但血跡卻濺到了柯南和平次的臉上，二人本以為可以通過(guò)血跡找到真兇，萬(wàn)萬(wàn)沒(méi)想到店內(nèi)的幾個(gè)客人身上均未發(fā)現(xiàn)血跡。正當(dāng)案件調(diào)查一籌莫展時(shí)，店內(nèi)一名自稱(chēng)和田進(jìn)一的男子突然念起一首和歌，平次和柯南馬上明白了此人的用意，并合力找出了真兇。

利用步美找到的暗號(hào)解讀表，柯南本以為能順利解開(kāi)暗號(hào)，不料卻遇到了瓶頸。正當(dāng)此時(shí)，若狹老師再次拜托少年偵探團(tuán)前往舊倉(cāng)庫(kù)尋找石灰。來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)的眾人發(fā)現(xiàn)倉(cāng)庫(kù)一片狼藉，在若狹老師不經(jīng)意的提示下，柯南終于解開(kāi)了暗號(hào)的含義，并推測(cè)犯人將再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)。為了避免打草驚蛇，柯南設(shè)計(jì)誤導(dǎo)犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)，柯南能否順利將犯人一網(wǎng)打盡？