軍豪不愿見到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國為名，表示愿放棄兒女之情，并險些喝下墮胎之藥。幸虧紀曉嵐以三寸不爛之舌，說服她靜待時日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀曉嵐難得默契合作，強行挽留住了他的腳步。 中秋佳節，皓月當空，卷帙浩樊的《四庫全書》編纂工作大功告成，皇上應邀來閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動產，生死攸關，太后以過來人的經驗竟擔當起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復蘇，破天荒地承認了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經曲折的姻緣終于名正言順，成為事實。 皇恩浩蕩，軍豪恢復狀元名號與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結為夫妻。勞苦功高的紀曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀曉嵐敲打，天下的不平之事由紀曉嵐主持公道……"

了凡記錄下來的涉及徇私舞弊的人員名單顯示敏德正是首貪。看到確鑿證據，乾隆下令抓捕敏德。收到和珅的消息，敏德連夜逃走。紀曉嵐建議乾隆從嚴查處涉案人員以警示世人，并重新閱卷以示公正。趙新進看到自己榜上有名，欣喜不已。敏德借和珅之名要見紀曉嵐，紀曉嵐不知有詐，被敏德襲擊。關鍵時刻，趙青救了紀曉嵐一命，自己卻受傷。乾隆下令斬首敏德，并決定重開恩科。和珅依然擔任主考官。紀曉嵐帶小月去專賣應考用具的“連升店”，看到無奇不有的作弊工具，還有一間名為“獨占鰲頭”的書院。

紀曉嵐從鴿子賣主口中得知鴿子可以傳信，聯想到和珅收購大量鴿子，紀曉嵐有所覺悟。趙青找到和珅，懇求其允許自己替哥哥考試。一曾經被紀曉嵐救助過的翰林將和珅收買眾翰林替考生答卷作弊并由鴿子傳送的消息透露繪紀曉嵐。紀曉嵐命小月在適當的時候燃放爆竹，以驅趕鴿群。趙青得知考生均要過“凈身池”很是擔心，她面露猶豫之色引起士兵的懷疑。正在兩人拉扯之時，紀曉嵐出現并堅決表示不會讓趙青進入考場。為了拉攏趙青為自己效力，和珅以趙青忠孝為由，懇請乾隆傳其入場，紀曉嵐卻以“無規矩不成方圓”為由大加反對。小月跟蹤和琳，發現了眾翰林答卷的密室，正當小月想要察看一番時，卻被和琳發現并打暈。小月醒來發現試卷已被鴿子帶走，便飛馬趕往考場。沒有小月的命令，等候放爆竹的人誰也不敢動手，眼睜睜地看著鴿群飛過。紀曉嵐將準備好的誘鴿放上天，鴿群在誘鴿的帶領下紛紛落地。小月趕到并下令放爆竹，結果鴿群受到驚嚇又再次飛上天，和珅幸災樂禍。得知自己高中，趙青深感愧疚，于大堂之上向乾隆揭露考試內幕。

盧焯告知和珅往來于兩人之間負責傳信的家丁被殺，雖然信件沒有丟，但在家丁身上卻發現了一首詩，暗示此舉是紀曉嵐所為。正當和珅擔心自己與盧焯的暗中交易有所敗露時，卻碰巧發現為了寫書而在茶社里擺攤收故事的紀曉嵐。乾隆向和珅詢問盧焯此人，和珅以為乾隆在試探自己。和珅假意推薦紀曉嵐前往浙江調查盧焯，誰知弄巧成拙，正合了乾隆的心意。和珅以買古董為由將乾隆帶到茶社附近，示意躲在暗中的阮媽適時出現，阮媽按照和珅的吩咐向紀曉嵐講述小月的身世，那邊廂，小月也在對杏兒講述著紀曉嵐對自己的恩德及自己對紀曉嵐的情意。紀曉嵐狼狽不堪地回到家里，提議讓小月嫁人，讓謠言不攻自破，小月氣極，表示除非讓皇上做媒

紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。