"2007年夏，2008年北京奧運會各項籌備工作都在緊張地進行。偌大的城市中，一位因為發現物理學不存在而信仰崩塌的女人自殺了，她叫做楊冬，是一個很有名的物理學家。警方通過取證判定，是由于過量服用安眠藥死亡。很快，現場被軍方接管了。警方隊長史強依然鎮定自若地坐在車里玩貪吃蛇，而配合調查的幾名科學家需要他們親自去請。楊冬事件令科學界惋惜，近兩年來已有數名科學家因自殺離世，這對于科學界可謂是一場巨大的災難。接觸科學節目特地邀請了著名生物學家潘寒，他曾成功預言轉基因作物造成的生態災難，他始終認為科技的過度發展是人類社會的一種病變，技術爆炸性發展就像癌細胞一樣飛速擴散，最終都是導致其寄宿體的死亡，如果地球毀滅的話，誰又能幸免。史強和軍方去了汪淼家中，剛開門就被提醒這里不能抽煙。史強想要了解的是汪淼和科學邊界學會成員接觸一事，汪淼愣了一下，回想起一些畫面后緩緩開口，科學邊界是國際學術界一個很有影響力的學術組織，它的成員都是知名學者。汪淼強調它是合法的，他為什么不能接觸呢？史強勉強地笑了笑，他并沒有說這是不合法的。汪淼表示自己有權不回答他的問題便要關門，被史強強硬阻止，汪淼有些不滿。史強連忙被拉走了

在史強看來，申玉菲的精神狀態簡直就是傳銷組織，今天最大的收獲就是楊冬，她在該自殺的時候沒有自殺，卻在快好的時候自殺了，這中間到底發生了什么，還需要去找丁儀。汪淼有些尷尬，為了楊冬去找丁儀不合適。所以史強沒有讓他去，而是讓徐冰冰去接觸丁儀。結婚對女人來說是很重要的事情，但是楊冬卻連自己的婚禮請柬都沒有親自去選，事實上她也并不喜歡逛街，衣服只買黑色和白色。汪淼之前在丁儀家看到過一條紅色的裙子，徐冰冰說是他們一起去買的，連吊牌都沒摘。至少那個時候開始，楊冬熱愛生活愿意開始改變了，但是汪淼認為這很不正常。那天楊冬和丁儀一起去逛街，一次都沒有提起物理學，甚至從那之后也很少有學術交流，那個時候的楊冬真的很放松。汪淼有些沉不住氣，史強得出結論楊冬和申玉菲接觸后決定放棄科研做一個家庭主婦，做一只無憂無慮的火雞，但是既然無憂無慮了又為什么要自殺呢？自殺前最后三天，楊冬并沒有接觸過申玉菲，很奇怪的是葉文潔并沒有提到過楊冬咋這段時間有什么不對勁，史強認為汪淼還需要找機會和葉文潔好好聊聊。汪淼氣呼呼的走了，認為他是在浪費自己時間。史強和常偉思聊過后認為申玉菲可能是外星人，立刻把自己的猜想告訴了汪淼，汪淼并不在

對于倒計時和宇宙閃爍的事情，汪淼找到了看似合理的解釋，畢竟一切超出科學的事情一開始都被認為是歪理邪說，申玉菲做了那么多事情無非是想讓他認為自己是一只火雞科學家，那他現在很想知道自己在哪個農場里，農場主又是誰，加入科學邊界會知道這一切嗎?申玉菲同意了汪淼的加入，并且給了他一個地址。潘寒認為申玉菲沒有讓汪淼停止實驗，這已經失敗了，在他看來申玉菲做的一切都是沒有意義的事情，但申玉菲并不這么想。汪淼去了申玉菲給的地址，這里是一個寺廟，但是和平常的寺廟又不太一樣。因為不收香火錢，所以游客少，來的一般都是科研人員。汪淼見到了韓教授，韓教授的話讓他有些摸不著頭腦。申玉菲終于出現了，她告訴汪淼，曼費教授的最后一站就是這里。汪淼希望知道農場主到底是誰，倒計時的盡頭又是什么，現在的他好奇心大于恐懼。申玉菲說這稱為神跡，神跡背后的東西不是每一個人都能接受的，她給了汪淼一個網址，如果可以汪淼可以親自去看看。一場研討會上，慕星遇到了潘寒，很激動地拉著他多聊幾句，還熱心地留了自己的電話。徐冰冰一直在跟蹤慕星，轉頭就把這一幕告訴了史強。汪淼登陸了申玉菲給的網址，是一個三體游戲，但是玩游戲需要裝備。史強立刻找常偉思報

陳雪告訴葉文潔，歐洲各部受到了拯救派的清洗，申玉菲的死一定也和潘寒有關系，陳雪希望她千萬不要去參加申玉菲的葬禮，否則一定會引起注意，降臨派也會懷疑她的立場。但葉文潔堅持去了，她要和申玉菲告個別。申玉菲一直想要解決三體問題，但最終還說絕望了。汪淼和史強都覺得有些可惜，早知道應該爭取一下申玉菲。汪淼決定回去玩游戲，看看會不會有什么不意義的地方。作戰中心查到了三體游戲的服務器，在一顆人造衛星上。但與此同時，潘寒已經關閉了三體服務器。正在游戲中的汪淼看到三體游戲直接轉換成為了最后的場景，所有的東西都消失了，只剩下一片虛無，三體世界所有的人都集合在了這里，形成了三體星艦戰隊，它們已經查到了十分之一的光速，目的地是地球，所有人都高喊著口號，尋找新的家園，那將是三體文明的新生。三體游戲結束了，最后提醒汪淼按照郵件地址參加聚會。史強心里很郁悶，萬萬沒想到三體是沖著地球來的。跟外星人打，我們就像透明人一樣。三體距離我們有四光年，理論上講四五十年就到了，但游戲里它們卻說需要幾百年，汪淼有些想不清楚。但很可能，我們在四十年后遭遇外星人的襲擊，但最壞的結果是也許他們在四十年前就出發了，我們根本不知道他們是什么

付心童和邊小方去游樂園的路上遇到了堵車，付心童下車調節卻越發暴躁，最后一發不可收拾地和路人吵了起來，邊小方攔都攔不住，一直不放心跟在后面的邊亮連忙上前把付心童和邊小方一起塞進車里。余母接到了校長的電話，說中中下午翻墻出去了，李漫卻說她身體不舒服被接回家了，余母很不滿意。邊亮和邊小方把付心童送去了醫院，事到如今他也不得不把付心童的病情告訴邊小方。醫生再三囑咐邊亮不能再發生任何疏忽，還告訴邊小方付心童很在意她的病情，希望邊小方和她一起去接付心童出來，并且要表現出并沒有被這件事情影響到的樣子。余母氣勢洶洶地沖到家里說要看中中，李漫掩護也被拆穿了，余光也得到消息回來了。余母劈頭蓋臉把李漫罵了一頓，李漫只好承認中中和周楠一起去參加滑板比賽了，余母一直不希望她碰滑板，一直希望她按照自己設計的路走。中中回到家就見到余母一臉怒氣，說要帶她回家，但是李漫卻護在中中身前說她是自己的女兒，結果被余母打了一巴掌，怒斥她根本不配當中中的母親。李漫只是希望余母知道中中很喜歡滑板，她覺得他們應該支持她。余母卻認為這是她的失職，余光終于站出來說了一句話，中中是他的女兒，她的教育他有責任，李漫剛才說的話是有道理的，中中