京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

和危言聳聽，恐嚇與利誘兼施，幸紀曉嵐及時趕到，將小月帶離和府。 皇上怪罪紀曉嵐尋人不利，要將他押往午門問斬，一直躲在閱微書房的莫愁被迫現身出面，紀曉嵐趁機要求金鸞殿上的皇上給莫愁名份，從此可以清清白白做人。但滿漢通婚，大清法律本不應允，要通過太后首肯，豈是易事！何況又有和等煽動一些大臣，尋隙報復，百般刁難。太后以祖宗之法罰，皇上表跪思過，患得患失之后，皇上決定讓步。 豐紳殷德一身武裝，將赴邊疆征戰。臨行之前，與軍豪剖白心跡。兩人相約，半年之內，均不談婚論嫁，建功立業后，再贏得小月芳心。 三姑自作多情，一心想與孑然一身的紀曉嵐成雙作對，害得一向無所畏懼的紀大人是心驚肉跳，避之不及。不出半年，豐紳殷德凱旋歸來，小月欣然坡門相迎，不想他已雙目失明。

"東南亞某地。東南亞貿易商宋金言和北極國際貿易公司總經理一起進貨停了車。孫和平，現任北方機械廠副廠長兼國際貿易公司總經理，在廠里很多人看來，孫和平只不過是個賣耗子藥的，說難聽了那就是不務正業，但是不得不承認孫和平賣一包老鼠藥的利潤超過了一臺發動機的利潤，占了我市海外銷售的半壁江山，很不客氣地說，廠里現在全靠孫和平養著呢。宋金言很想要孫和平的耗子藥和發動機的代理，但是孫和平始終沒有答應。二人正在閑聊，幾輛警車突然到來，幾位特警端著槍朝他們緩緩逼近。北方機械廠黨委會討論新的廠長，孫和平是最好的候選人，指望他回來救廠子但是依舊有不少反對的聲音。廠子面臨倒閉，錢很重要。而此時，孫和平和宋金言面對東南亞的警匪大戲，躲在車底保命。這個時候接到錢書記打來的電話，讓孫和平回來當廠長，然而孫和平不愿意，更別說現場槍聲不停，他今晚也許就在這兒犧牲了。槍聲好不容易停了，孫和平松了口氣，但是他的老鼠全被打死了。宋金言聽說孫和平要回國的消息心情有些復雜，還在爭取東南亞的代理權，畢竟他們都快破產了。孫和平不同意，只要有他在，北機就不可能破產！龍書記要調到市里享清福了，錢書記請求他留在這里再幫幫自己，卻遭到了無情的

小月望著一片廢墟、傷心之極。從小春口中得知紀曉嵐等已從暗道逃走，小月破涕為笑。乾隆向百官念叨缺少銀兩以備軍需，紀曉嵐帶領著工匠出現，許諾可以幫乾隆解決難題。人證、物證俱在，齊蘇圖只得低頭認罪。銀妃以死要挾乾隆放過齊家。見乾隆不為所動，銀妃自盡。和珅為了擴大自己在朝中的勢力，暗中支持村夫李二組織邪教，從而謠言惑眾，籠絡人心。一時之間，朝廷內外盡是李二的信徒。工部因大做法事導致衙門失火。和珅答應撥款給工部金尚書以重修工部衙門。御史海升之妻組氏參加了當日作法，海升將失火原因告知了紀曉嵐。和珅同黨吳省蘭將作法用書《佛法心經》奉與皇上，并夸口只要通讀此書，便可百病不侵。和珅不失時機地推薦吳省蘭任左都御史。乾隆以紀曉嵐著成《四庫全書》為由，指派他上任左都御史，并對其寄予厚望。紀曉嵐上任之時，和珅的黨羽劉構傲慢無禮地當眾打坐，向紀曉嵐挑釁。紀曉嵐覺察出邪教實力強大，決定剝繭抽絲，調查到底。

紀曉嵐在眾信徒面前一一揭露了李二設下的騙局。眾信徒醒悟，李二只得低頭認罪。紀曉嵐將當初留在海升之妻身上的四指掐痕與任五的手印做對比，兩者吻合，乾隆意識到海升被陷害。紀曉嵐讓海升與小芳做臨別遺言，兩人真情流露，隔壁的乾隆終于了解了冤情。乾隆下令嚴懲真兇，并賜海升與小芳完婚。早朝之時，乾降于閑談之中指出朝廷里存在結黨營私、欺上瞞下的現象，百官皆心虛不已，噤若寒蟬。下朝后，和珅竭力表示自己一身清白，卻偏偏遇到了正在等候自己的同黨——浙江巡撫盧焯。