小蘭的母親妃英理在自己的事務所突然被人綁架，但她趁綁匪不注意躲進了廢棄的大樓內，并用搶來的手機向小蘭求救，雖然遭到了綁匪的干擾但柯南還是分辨出來了妃英理所發的信息內容，從中獲得了一些線索后柯南帶領小蘭和小五郎立刻展開救援，但被綁架的地點可能有兩處，柯南能在危急時刻找到正確的位置嗎？

柯南和平次傳來歷史學家的死訊，眾人陷入恐慌，并認為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學家主動要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長詢問細節，院子卻突然再次著火，與此同時樓上的考古學家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房內，待柯南等人趕到時已經喪命。經過一番調查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。

終于熬到了周一，足球隊員問米小圈怎么沒有去打球，米小圈也很無奈，米爸讓他好好練習畫畫，今后好成為聞名世界的大畫家，隊員樂不可支，稱終于將力量相當的米小圈逐出隊伍，今后便可以自己成肌肉老師心目中的第一名了。聽到隊員這句話，無異于給米小圈一個殺手锏，他憤憤不平但是毫無辦法。接著，米小圈又收到一封來自未來的信箋，上面讓他噴水再看，結果米小圈照做，果真看到上面的字了，上面寫著米小圈將來是個大畫家，并且享譽全世界，讓米小圈抓緊現在的每一分鐘好好學習。信箋背后的署名是未來的米小圈。米小圈才不會那么傻，他拿著信箋跑去找米博文，稱自己知道他的伎倆，知道那封字跡會消失的信箋是他寫的，并且叮囑米博文今后還是不要費力氣了，他還是喜歡踢足球，根本不想成為畫家。米博文愣愣站在那里，臉上帶著一副無辜的表情。米小圈將那封來自未來自己的心給車遲說了，車遲卻覺得這是一個非常好的創意，剛好為他未來的發明指明方向，看到車遲什么都能聯想到未來，米小圈很是無奈。沒過多久，米小圈又接到一封匿名信，對方又稱是未來的米小圈寫的，并且稱米小圈未來真的就是一個畫家，并且為了證明他說的沒粗，還給了米小圈另外三個預言，就是米小圈會吃到一餐大

7年前杯戶街上發生了一起搶劫殺人案，案件當時只有一個目擊證人，那就是5歲的小女孩友里未央奈。7年后小五郎帶著蘭和柯南一起來到鳩笛莊度假，友里未央奈正是鳩笛莊女主人的女兒。來度假的客人井出正也無意間談起了7年前很熱門的特攝劇彗星假面超人比恩，這讓友里未央奈陷入了恐慌之中，因為當年那起搶劫殺人案的犯人戴的就是假面超人比恩的面具。

在幫純子小姐調查入室偷竊的時候小五郎和柯南遇到了一起命案，死者是純子小姐的鄰居北上先生，初步判斷為酗酒墜樓，但在高木警官調查附近鄰居時柯南看出了端倪。所調查的房間里柯南看到了幾處線索，這些都可以說明北上并非意外墜亡，但是柯南還是沒有找到關鍵的證據，小五郎在電梯里整理儀容時柯南突然明白了什么。