在參加大學(xué)校慶的柯南和小蘭等人遇到了殺人事件，就在警官要判定為自殺事件的時候，在柯南的引導(dǎo)下警方判斷此次為他殺事件。而安菜在小蘭她們進來之前已經(jīng)死亡，但此時如何讓桌子擺動的事情成為了破案的關(guān)鍵，而表演時站在安菜周圍的三人成了重點懷疑對象。經(jīng)過對現(xiàn)場的調(diào)查柯南很快發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法和犯人的身份，在確鑿的證據(jù)面前犯人最終承認了罪行，并說出了殺死安菜的理由。

這三輛白色FD的后備箱中分別放置了釣魚桿、高爾夫球袋和橡皮艇，就在警方準(zhǔn)備進一步調(diào)查時，曾經(jīng)與銀白魔女有過一面之緣的山村警官的奶奶否認了銀白魔女就在他們其中，雖然沒能找到魔女，但柯南卻注意到有一組車手的供詞中有疑點，于是，他和小五郎再次駛向霧蒙蒙的冬名山，而魔女的白色FD也再次出現(xiàn)，這一次他們能成功狩獵魔女嗎？

阿笠博士帶少年偵探團來到一家位于箱根的溫泉旅館，那里正好在進行《血殷殺手》系列最新作品的拍攝，因此，大家結(jié)識了劇作家鐵山巖治、女主角名取深汐、經(jīng)紀人丹沢純作以及男主角寺堂云平。次日，元太他們一起去湖上露天溫泉的時候，卻在女湯發(fā)現(xiàn)了鐵山巖治的尸體，從現(xiàn)場來看兇手應(yīng)該是在發(fā)案之后趁機混入了騷動之中，調(diào)查之后，警方將嫌疑鎖定在深汐、丹沢、寺堂三人中。

妖怪倉庫是把貴重的物品放進里面就會立刻消失的倉庫，少年偵探團為了弄清真相決定一探究竟，元太他們?yōu)榱俗尶履下冻鰺o話可說的表情而干勁滿滿。在調(diào)查了倉庫內(nèi)部之后，柯南只看到了地板上留下的零星腳印和嵌在墻上的大算盤，除此之外別無他物。但從外面的天窗向里面看的話，就能看到堆積如山的寶物，可意外的是當(dāng)再次打開倉庫的門時，里面的寶物就全都消失不見，柯南提出的天花板和地板機關(guān)的猜想被光彥等人否認，難道妖怪倉庫真的存在？

意外的是門把上留下的指紋竟然是諸伏高明警官的部下，為找尋更多線索，大和刻意讓柯南跟著高明警官去曾經(jīng)住在別館里的翠川尚樹、山吹紹二、百瀨卓人和直木司郎家進行詢問，高明警官謊稱在門把上檢驗出他們的指紋來觀察他們的反應(yīng)，不所料直木司郎聽說了這件事之后神色緊張，就在大家以為他是兇手，準(zhǔn)備進一步進行調(diào)查時，直木司郎被人殺死，而他家里的其中一面墻壁被涂成了紅色。