卡特犧牲后，萊斯特任命珍妮來接替他的工作。探測器測到異常點在一座廢棄的大樓里，珍妮帶人立刻趕到，不想卻被克里斯蒂娜·約翰遜攔截，克里斯蒂娜否認有異常點，萊斯特懷疑克里斯蒂娜的所作所為與軍方有關。總是纏著珍妮不放，想得到大新聞的記者米克偷走了珍妮的手持探測器并設計調開了珍妮等人。米克搶先來到異常點放生地，誰料巨大的巨獸龍跑了出來，大鬧機場，幸虧丹尼趕來幫忙才把巨獸龍引回異常點。通過這次斗爭，新的領導者珍妮變得更加成熟。

一大早，海莉向父母告狀說艾麗克斯看了她的日記本。艾麗克斯矢口否認。克萊爾跟菲爾說，發現盧克在電腦上看色情圖片。其實電腦上的圖片是菲爾看的。只是那些圖片是菲爾的同事發給他的鏈接，菲爾不知道是那種圖片所以點開看了。可是菲爾又不好意思向克萊爾承認。克萊爾要找盧克談談，菲爾趕緊自告奮勇地裝作去跟孩子溝通，其實他是怕事情敗露。因為偷看海莉日記本的人是盧克，盧克看到海莉冤枉艾麗克斯很過意不去，于是主動找克萊爾承讓錯誤，說自己不應看不該看的東西。但克萊爾誤以為他是就看色情圖片的事認錯，于是就事論事的對他進行了深刻的教育，結果陰差陽錯地把孩子們本不知道的事公之于眾。盧克表現的非常吃驚。而克萊爾在教訓盧克的時候，失口說出因為關心和擔心海莉，她也偷看過海莉的日記本。海莉生氣極了。卡梅隆發現園丁在花園里邊干活邊流淚，他非常好奇和同情園丁。于是他把園丁請進家里詢問園丁。但園丁講的西班牙語，卡梅隆基本聽不懂，但好奇心促使他僅憑聽清的幾個詞揣測園丁的意思。米奇爾很不喜歡卡梅隆這種過于熱心和好奇心太重。結果從園丁進到他們家以后，莫名奇妙的人接二連三地來到他們家里，等米奇爾回到家時，家里匯聚了一屋子跟園丁有關的人，園

一個異常點出現在M25號高速公路上，這次穿越時空的是世界上最大的象－－（美洲）猛犸象！Connor、Abby和Cutter費了一番周折才將猛犸象制服，但此時異常點已經消失，眾人只好將猛犸象帶回異常點研究中心。猛犸象的出現讓一名來自《今晚報》的一名記者起了疑心，他發誓要將真相追查到底。 與此同時，Cutter秘密與Connor、Abby和Stephen商討對付 ""叛徒"" 的事，但是Stephen心中卻另有想法。Helen再次來找Stephen，Stephen被她說動了心，準備和Helen一起行動。但是念在自己與 Cutter多年的交情，Stephen決定再給Cutter一次機會－－他要找他好好談談。Helen卻不以為然，認為Cutter根本聽不進去。事情果然如Helen所料，當Cutter發現Stephen與Helen在一起，立即宣布 ""開除"" Stephen，甚至對他拳腳相向，兩人的矛盾完全公開化了。受傷的Stephen回去找Helen，Helen表面上好言安撫Stephen，背地里仍然與Leek保持著密切聯絡。 Cutter與Connor秘密改造了異常點探測器，并布下一個局，

異常點開啟在醫院里，這回光顧的是二疊紀的雙齒獸，它們活潑可愛，就是愛惹些小麻煩。再加上趕上孕婦梅勒妮生產，簡直搞得卡特等人焦頭爛額。當一切處理妥善，卡特等人回到異常點研究中心時，卻發現那里已被海倫和她的復制品手下們所控制。海倫逼迫卡特說出一個不明物品的用處，卻遭到了拒絕，于是惱羞成怒的海倫命令手下引爆炸彈。幸運地被救出火海的卡特，卻重新沖回火海尋找一個重要的盒子，不想卻慘遭海倫的毒手。彌留之際，卡特將不明物品交給康納，并囑咐康納代替自己繼續異常點的研究。

"中出現的高智慧未來生物！Lester平日里一副不經事的模樣，此時此刻卻表現得異常英勇。最終，在猛犸象的“幫助”下，兩個未來生物都被殺死了。 趕回來的Cutter與Connor等人開始破譯Leek的個人檔案，但是他們萬萬沒有想到——他們又中了Leek的詭計，一個定時炸彈被啟動了，異常點研究中心危在旦夕！不過，聰明的Cutter在最后關頭阻止了炸彈的爆炸。隨后，Cutter發現那些未來生物被安裝了遙控控制器，于是叫Connor用異常點探測器檢查遙控信號的源頭。Lester堅持要求軍方控制局面，禁止 Cutter等人參與行動。但是Connor用異常點探測器找到了Caroline的手機信號，于是決定和Abby一同去尋找被“綁架”的Rex。閑得無聊的Cutter也跟了過去，順便拉上了無事可做的Jenny。 當眾人跟蹤Caroline的手機信號來到一個廢棄倉庫時，等待他們的卻不是Caroline，而是Leek和他荷槍實彈的雇傭兵！還有Helen！還有……第二季中出現過的所有遠古（未來）生物！ 一只兇猛的怪獸大軍已然形成，世界將陷入一片混亂。在這個關鍵時刻，有一個人挺身而出，成了最關鍵的人物……究