某日，一個(gè)自稱柯南媽媽的陌生女人來(lái)接他，柯南第一反應(yīng)就是她可能是黑衣組織的人，因?yàn)樗宄履霞业牡准?xì)以及他的真實(shí)身份，期間，柯南雖趁機(jī)逃脫，但去找阿笠博士的時(shí)再次候被抓，他聽(tīng)到了那個(gè)女人和一個(gè)面具男討論交易藥物的事情，待他們離開(kāi)后柯南按照那伙人留下了線索找到交易地點(diǎn)，可不幸的是他行跡暴露，面具人對(duì)他槍口相向……

米花博物館將要舉辦珠寶展，園子家的「黑暗星辰」也要參展，可在此之前，園子家收到了一封來(lái)自怪盜基德的盜取通知信，柯南解開(kāi)通知信的暗號(hào)后來(lái)到杯戶市立飯店屋頂，基德在月色中憑空到來(lái)，將警方內(nèi)部搞的一團(tuán)糟后，順利逃跑，并留下通知信說(shuō)他定會(huì)盜走「黑暗星辰」。宴會(huì)當(dāng)天，園子的母親給上船的每個(gè)人都發(fā)了一顆黑珍珠，混淆視聽(tīng)，可基德手法更高一籌，他偽裝成了鈴木會(huì)長(zhǎng)登上船只。

放學(xué)后，光彥一伙兒聚在一起研究寬波段接受器時(shí)，無(wú)意中接聽(tīng)到了一個(gè)綁架恐嚇電話，大家都很擔(dān)心這個(gè)被綁架的女孩性命，便決定根據(jù)這通電話找到女孩，柯南根據(jù)歹徒陸續(xù)打給女孩爸爸的電話，和伙伴們一步步找到了被害人和歹徒的位置，成功解救人質(zhì)。

園子、小蘭和柯南三人一起參加搖滾樂(lè)團(tuán)雷克斯的慶功宴，卡拉OK包廂內(nèi)，大家都因雷克斯樂(lè)團(tuán)將要解散而面露悲傷，在主唱達(dá)也演唱完《血紅的維納斯》后，中毒猝死，在場(chǎng)的人都有作案的嫌疑，柯南無(wú)意看到達(dá)也以前的樂(lè)團(tuán)照片后，便明白了兇手是誰(shuí)，他躲在暗處以工藤新一的身份將兇手揭露，而因這場(chǎng)兇案牽扯出的愛(ài)恨情仇也無(wú)疑讓所有人扼腕嘆息。

小五郎錄制全日本偵探社的錄制節(jié)目時(shí)，制作人諏訪被射殺，主持人松尾的嫌疑最大，因?yàn)樗巧鋼舾呤郑⑶宜诓シ艂商蕉唐乃姆昼妰?nèi)離開(kāi)過(guò)攝影棚，但柯南怎么也想不明白，他是如何在這么短的時(shí)間內(nèi)往返于九樓和四樓之間，在了解了大樓構(gòu)造后，柯南終于明白了兇手的伎倆，他麻醉了小五郎并借來(lái)攝像機(jī)，向全國(guó)實(shí)況轉(zhuǎn)播了小五郎的推理秀。