在靜岡縣寫(xiě)小說(shuō)的推理作家海棠千賀小姐招待毛利小五郎來(lái)她住的別墅，希望小五郎分享關(guān)于名偵探的辦案經(jīng)驗(yàn)，沒(méi)想到見(jiàn)面后卻沒(méi)有要聽(tīng)小五郎分享的意思，而是一直在說(shuō)自家人內(nèi)部的矛盾。次日早上醒來(lái)的柯南等人發(fā)現(xiàn)海棠一家還沒(méi)起床，再到臥室后才發(fā)現(xiàn)海棠夫婦以及海棠小姐的徒弟幸子小姐全部都被毒殺。

柯南以工藤新一的身份聯(lián)系沢栗熏，并讓他拍照傳送這三位嫌疑犯的簽名書(shū)，期間，新一得知了沢栗熏的外號(hào)鶯鳥(niǎo)并推敲出了沢栗未紅取綽號(hào)的規(guī)則，根據(jù)死者生前在SNS留下的信息，新一知道了兇手是誰(shuí)，但他卻無(wú)法冒著犧牲兩條人命的風(fēng)險(xiǎn)揭露真相，所幸警方的狙擊手已經(jīng)就緒，然而，小蘭卻做出了讓人吃驚的舉動(dòng)……

來(lái)到正南家里的少年偵探團(tuán)的各位開(kāi)始玩起了花牌，而游戲中正南好像利用花牌向小哀他們傳遞了什么信息。缺少柯南的少年偵探團(tuán)的各位開(kāi)始分析正南的用意，通過(guò)小哀的推理確定了正南的母親的所在地，就在這時(shí)小哀突然發(fā)現(xiàn)了陌生的手機(jī)，而此時(shí)兩名犯人也露出了真相。突然門(mén)鈴響了起來(lái)！就在犯人開(kāi)門(mén)接收快遞的時(shí)候柯南和高木趕來(lái)救援！

繼輕井澤別墅中的若松先生遇害之后，他的兒子玉郎也在東京的家中被毒殺，不可思議的是除了玉郎吃掉的那塊蛋糕意外并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)其他的蛋糕上有毒。于此同時(shí)，大和敢助警官等人注意到了被殺害的若松先生浴室的瓷磚是運(yùn)用了一種名為陰影鉆石錯(cuò)視的會(huì)引發(fā)視覺(jué)錯(cuò)覺(jué)的形狀，總算讓若松社長(zhǎng)的死亡訊息再次顯現(xiàn)出來(lái)，而現(xiàn)實(shí)出的字母竟是SON。

紅色噴漆事件是近期發(fā)生的惡性連續(xù)破壞車(chē)輛案，沒(méi)想到千葉警官的車(chē)子也遭到毒手，接到報(bào)警電話(huà)和由美警官一起趕來(lái)的女警新人竟然就是千葉警官的初戀情人淼子，知道這些的柯南等人順?biāo)浦圩屒~和淼子一起調(diào)查此案，想要借此機(jī)會(huì)讓遲鈍的千葉回想起來(lái)，而在兩人調(diào)查的地下停車(chē)場(chǎng)內(nèi)卻發(fā)生了追撞事故，而這次事故似乎與紅色噴漆事件有著關(guān)系。