警方在繩子和藥瓶上發(fā)現(xiàn)的指紋居然不是屋子里任何一個(gè)人的，那么就排除了他們犯案的可能，再休息之前柯南建議警察再次對他們每個(gè)人的怪癖進(jìn)行調(diào)查確認(rèn)，然而，卻并沒有發(fā)現(xiàn)有何異常，案件一度遭遇瓶頸，到底是忽略了哪里的線索？這時(shí)，小蘭無意中的一句話提醒了柯南，原來犯案的不止一人。

小蘭開始懷疑柯南的身份就是新一，拾到柯南遺落的手機(jī)的小蘭，想用發(fā)送手機(jī)郵件的方法來確認(rèn)真相。當(dāng)小蘭按下了電源開關(guān),卻出現(xiàn)手機(jī)解鎖的畫面。正當(dāng)她為解除4位密碼冥思苦想時(shí)，小蘭回想起半年前與新一的約會并解出了密碼。但發(fā)送給新一的郵件卻并沒有發(fā)送到柯南的手機(jī)上，而這時(shí)新一也打來了詢問的電話，最終小蘭打消了對柯南的懷疑。

小五郎受狩谷伴子太太所托來到狩谷家?guī)退冶慌獊G的手機(jī)，隨后大家分別對可能拿走手機(jī)的大策、嗣貴和滋英進(jìn)行詢問，卻并未找到，反而在小五郎等人離開的時(shí)候，伴子找到了手機(jī)。本以為一切就此結(jié)束，誰也沒想到伴子當(dāng)晚就遭人殺害，警方對狩谷家的人一一進(jìn)行偵訊，卻發(fā)現(xiàn)每個(gè)人都有不在場證明，期間，家里的仆人提起了12年前所發(fā)生的事情……

某日清晨，柯南等人正在觀察4只青蟲時(shí)看到有警車在附近?？?。為打探消息柯南他們隨即趕往現(xiàn)場。根據(jù)高木刑警的敘述得知，獨(dú)自生活的一位老人被殺。利用午休時(shí)間，高木等人來到學(xué)校。據(jù)說昨晚，有個(gè)少年剛巧目擊了犯罪經(jīng)過警方隨即來尋找那名少年。高木雖然找到了那名目擊者圭一，但是圭一卻不承認(rèn)看到過犯人。

中午，昏昏欲睡的柯南和小五郎被樓下的一聲巨響驚醒，趕到現(xiàn)場后發(fā)現(xiàn)一名駕駛摩托車的年輕人出車禍而死，他的旁邊散落著大量現(xiàn)金，柯南還發(fā)現(xiàn)了一封信和一盒裝有注射藥物的盒子，根據(jù)信的內(nèi)容推斷出這是為贖一個(gè)叫堂本的人而準(zhǔn)備的現(xiàn)金，警方順藤摸瓜到了堂本家，家人也都肯定了堂本被綁架的事實(shí)，柯南從女仆那里了解到堂本家的內(nèi)部關(guān)系后，認(rèn)定這并不是一起簡單的綁架案。