和珅與齊蘇圖懷疑紀曉嵐是裝瘋。為了檢驗藥性，齊蘇圖抓來洪仁，用他做實驗，結果發現確實靈驗。小月看出已經被毒黑的碎銀可能是證據，于是細心保存起來。銀妃用銀票討好太后，以求太后給乾隆施加壓力，替齊家隱瞞罪證。厲春梅為古大力的安危擔心，古大力表示會努力讓厲家姐弟過上好日子。乾隆要懲治齊家，與小月來到工地冒充民工，救下了正要被齊家滅口的古大力等工匠。紀曉嵐趁杏兒做飯的工夫離家出走，走至厲家門口時被追殺工匠的齊家馬車撞倒。厲家姐弟將紀曉嵐扶回家療傷。乾隆和小月將工匠們帶到一荒廟，讓他們在此落腳。古大力對乾隆和小月的身份很是懷疑。為防不測。古大力帶領眾民工挖了一條暗道。紀曉嵐無意中得知遺失的兩枚元寶就在厲家姐弟手里，佯裝可以教厲小春識字而留在厲家。和珅見洪仁的病情越發厲害，于是讓劉全殺其滅口。小月和杏兒碰到了正趕車去郊外殺人滅口的劉全，小月感到其中有蹊蹺，于是將洪仁救回家。

客棧老板以假當真，錯把紀曉嵐當作是戶部尚書、當今皇上的心腹寵臣和，趕緊偷偷稟報燕城統領，卻搞得這幫人十分為難，不知如何接待，才能既表了“忠”心，又不拂逆了“和大人”的本意。 和以穩定江山社稷為理由，鼓舌如簧，誘騙十四王爺上鉤，抗旨離開云州赴燕城；四姑娘則借助福康安對自己的單相思，弄清了這是一個陰謀。但她報仇心切，決定將計就計，索性把一片癡情的福康安挾為人質，作為解救王爺的砝碼。 在皇上的授意與允諾下，紀曉嵐把和的官印做了調換，本意是使燕城之行在萬不得已時可以順利進行。不想客棧內再次與那些守城的衙役相遇時，此人竟嚇得面無人色，急忙作揖打恭求饒不已，而燕城和府劉常富率隨從必恭必敬盛宴款待，也讓他對和與此地貪污案關系有了更深懷疑。索性將錯就錯，以和之名，借機盤查一些不易為外人所知的內幕。

紀曉嵐頗為欣賞如玉的才情，于是讓如玉女巧扮男裝，跟隨自己去大內看《四庫全書》的編纂。和珅將紀曉嵐寫下的奏章呈給乾隆，乾隆大悅，讓紀曉嵐在宮中騎馬作為獎勵。和珅散布謠言說紀曉嵐當初扣下顏驥的藏書只為查反書以取說皇上，眾官皆信不已，紀曉嵐有口難辯。顏驥的學生戴沾一直潛心幫紀曉嵐著書，得知此消息，痛斥紀曉嵐道貌岸然，被官府以辱罵朝廷命官為由投進大獄。紀曉嵐見到奏章實為自己筆跡，百思不得其解。小月深夜潛入和府要盜出迷魂煙草，不料中了和珅的圈套，將假煙草拿回了紀府。紀曉嵐檢驗煙草的真偽，不料牙齒被煙草染黑。早朝時，和珅看到紀曉嵐閉口不語很是幸災樂禍，并千方百計的讓紀曉嵐在乾隆面前開口。紀曉嵐將計就計，引經據典，表示“黑齒”之舉只是為了提醒皇上理政之道。乾隆深感紀曉嵐的一番苦心，高興之余獎紀紀曉嵐煙草，紀曉嵐表示愿意用煙草換戴沾免罪。戴沾同意前往紀曉嵐家中繼續編纂《四庫全書》。和珅找到神父，表示要捐資修教堂，神父經受不住誘惑，將紀曉嵐佯裝找到迷魂煙草的真相全盤托了出。如玉與戴沾同在紀曉嵐家中。見到戴沾的正直之舉，如玉很是欽佩。

紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

軍豪不愿見到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國為名，表示愿放棄兒女之情，并險些喝下墮胎之藥。幸虧紀曉嵐以三寸不爛之舌，說服她靜待時日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀曉嵐難得默契合作，強行挽留住了他的腳步。 中秋佳節，皓月當空，卷帙浩樊的《四庫全書》編纂工作大功告成，皇上應邀來閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動產，生死攸關，太后以過來人的經驗竟擔當起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復蘇，破天荒地承認了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經曲折的姻緣終于名正言順，成為事實。 皇恩浩蕩，軍豪恢復狀元名號與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結為夫妻。勞苦功高的紀曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀曉嵐敲打，天下的不平之事由紀曉嵐主持公道……"