為了消除基德偽裝成他人的可能，少年偵探團(tuán)分別承擔(dān)起了看守四個(gè)臺(tái)座的重任，就在這時(shí)，屋內(nèi)突然停電，只能聽(tīng)見(jiàn)電流嗞嗞的聲音以及窗外吹進(jìn)的風(fēng)的呼呼聲，屋內(nèi)很快恢復(fù)了光亮，但大家發(fā)現(xiàn)在這短短的一分鐘內(nèi)，基德不動(dòng)聲響的將柯南電暈打開(kāi)中間的立柱盜走了麒麟角，灰原發(fā)現(xiàn)這四個(gè)臺(tái)座分別代表了四神獸，這或許與三水吉右衛(wèi)門(mén)刻在柱子上的話(huà)相關(guān)，在沒(méi)有柯南的幫助下，少年偵探團(tuán)能否找到被盜的麒麟角？

就在兇手企圖用球棒襲擊被騙到音樂(lè)室的小林老師時(shí)，他卻反過(guò)來(lái)被小林老師撂倒，這時(shí)，少年偵探團(tuán)和白鳥(niǎo)警官出現(xiàn)，原來(lái)小林老師早已被白鳥(niǎo)警官所保護(hù)而眼前這個(gè)人正是佐藤警官，期間，小林老師想起了以前在書(shū)店發(fā)生的事情，誤會(huì)消除的二人重歸于好。麒麟角是鈴木次郎吉在山中寺廟發(fā)現(xiàn)的寶物，而基德又以此為目標(biāo)出了預(yù)告函，次郎吉率領(lǐng)基德無(wú)法喬裝的少年偵探團(tuán)以及進(jìn)行直播的工作人員來(lái)到寺廟，麒麟像被藏在寺廟的立柱中間，想要拿取它并非易事……

小五郎受邀來(lái)到Nijimura品牌店，卻正好目擊社長(zhǎng)仁地村被人綁架的畫(huà)面。社長(zhǎng)的妻子兼副社長(zhǎng)沙希，按照綁架犯的要求帶著一億贖金搭電車(chē)解救人質(zhì)，就在電車(chē)開(kāi)往中戶(hù)呂鐵橋的時(shí)候，沙希按照指示將包包從窗戶(hù)丟到河里，而此刻正趕上泄洪，包包隨著增加的河水被沖走，待警方在五公里外的河岸發(fā)現(xiàn)時(shí)，贖金已經(jīng)被犯人拿走，而社長(zhǎng)仁地村也被殺害。雖然事情已經(jīng)結(jié)束，但柯南和小五郎卻重返現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行調(diào)查，并發(fā)現(xiàn)……

柯南他們一行人前往亂舞璃神社的酉日集市，沒(méi)想到園子的背包竟然被頭戴火男面具的酉之男搶走。在他們第三酉日來(lái)到亂舞璃神社時(shí)，酉之男再次出現(xiàn)并刺傷復(fù)讀生益子士郎，益子昏迷前說(shuō)“不是酉是猴子”并比劃出數(shù)字九，可這到底是什么意思？之后，警方在酉之男藏身的公園廁所里發(fā)現(xiàn)了三名男子火野辰男、猿川久巳、水江申次，同時(shí)還在小蘭的錢(qián)包里發(fā)現(xiàn)了一粒紐扣，當(dāng)?shù)弥@是酉之男的紐扣后，警方對(duì)三人展開(kāi)了搜查……

來(lái)到倫敦的柯南不小心以新一的身份向小蘭暴露在倫敦的事實(shí)，而此時(shí)柯南喝下了回國(guó)用的解毒劑暫時(shí)以新一的身份出現(xiàn)！在繼續(xù)調(diào)查的過(guò)程中小蘭從以前新一說(shuō)過(guò)的話(huà)中得到啟發(fā)發(fā)現(xiàn)了人偶的秘密。而之后通過(guò)與新一電話(huà)中發(fā)現(xiàn)了更多的線(xiàn)索。這時(shí)小蘭和小五郎碰到了米奈芭小姐，在米奈芭和弟弟阿波羅的協(xié)助下小蘭留在教堂的紙片，而上面寫(xiě)著的就是接下來(lái)的線(xiàn)索。