自稱宇智波信的敵人左臂里埋入了復數的寫輪眼，這讓鳴人和佐助聯想到了大蛇丸，為了救回小櫻他們決定前往大蛇丸的基地。在大蛇丸的基地里佐良娜看到了和爸爸合照的鷹小隊成員，她私下詢問水月關于香燐的事情，并稱香燐可能是自己的親生母親，多事的水月拿出香燐留下的臍帶樣本比對DNA，沒想到竟與佐良娜的DNA完全吻合。

尸澄真等人拿到忍刀后準備組建新的忍刀七人眾引發革命，長十郎得知后準備肅清他們，如果有必要的話神樂也難逃一劫。博人說服長十郎準備私下解決這次的叛亂，他打算把事態控制到小鬼打群架的程度，沒有更好辦法的長十郎決定陪博人和佐良娜一起行動，而其他同伴也偷偷跟了上去，但持有忍刀的尸澄真一行并沒有那么好對付。

中忍考試第二場比賽開始了，搶奪旗幟戰的規則是在守住自家旗幟的同時進攻敵陣，這場比賽將要淘汰半數的隊伍。第七班選擇博人駐守陣地，而巳月和佐良娜展開攻勢，讓他們沒想到的是敵方三人全都選擇進攻，千鈞一發之際博人使用了科學忍具。得知兒子通過第二場比賽后鳴人非常高興，但他還不知道博人的作弊行為。

佐良娜的對手是打敗了井陣的荒矢，異常冷靜的荒矢在寫輪眼面前都沒有露出絲毫破綻，佐良娜恰到好處的幻術竟也沒有起到作用。戰斗中佐良娜看出與自己交戰的只是傀儡，而控制傀儡的荒矢一開始就不在賽場內，佐良娜獲勝后是巳月與新希的比賽，需要隱藏實力的巳月能否戰勝新希呢？

白夜團利用民眾游行包圍了雷門公司，但他們真正的目的則是片助的科學忍具研究所。當大家的注意力全被雷門公司吸引時白夜團搶走了研究所的忍術資料，鹿臺意識到這一點后立即與博人等人趕了過去，他們依靠片助的跟蹤器找到了白夜團，在同伴們的掩護下鹿臺和博人追了上去，他們能阻止白夜團的陰謀嗎？