警方將嫌疑人鎖定在三個(gè)人身上，考慮到兇手很可能是關(guān)西人，服部要求親自對(duì)他們進(jìn)行偵訊，這些人分別是須貝、甘粕和東條，他們都聲稱自己是地道東京人，并且偵訊期間并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)什么異常，之后，在旁吃飯的小蘭等人提供了一些線索，這讓柯南茅塞頓開(kāi)，原來(lái)兇手就是那個(gè)人！他讓餐廳為這三個(gè)嫌疑人分別準(zhǔn)備一碗味增湯，并說(shuō)只要喝下就能真相大白。

在靜岡縣寫(xiě)小說(shuō)的推理作家海棠千賀小姐招待毛利小五郎來(lái)她住的別墅，希望小五郎分享關(guān)于名偵探的辦案經(jīng)驗(yàn)，沒(méi)想到見(jiàn)面后卻沒(méi)有要聽(tīng)小五郎分享的意思，而是一直在說(shuō)自家人內(nèi)部的矛盾。次日早上醒來(lái)的柯南等人發(fā)現(xiàn)海棠一家還沒(méi)起床，再到臥室后才發(fā)現(xiàn)海棠夫婦以及海棠小姐的徒弟幸子小姐全部都被毒殺。

泡沫、熱氣和煙的實(shí)驗(yàn)與室溫并沒(méi)有關(guān)系，在聽(tīng)到三人單獨(dú)的問(wèn)話后柯南鎖定了兇手。再次來(lái)到公寓的柯南又實(shí)施了實(shí)驗(yàn)，事發(fā)時(shí)吵鬧不停的鬧鐘和他們到達(dá)案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的時(shí)間成為了案件的突破口，而柯南也明白了制造出不在場(chǎng)證明假象的手法，案件的真相終于揭曉，而在真相的背后又隱藏著不為人知的悲劇。

紅色噴漆事件是近期發(fā)生的惡性連續(xù)破壞車輛案，沒(méi)想到千葉警官的車子也遭到毒手，接到報(bào)警電話和由美警官一起趕來(lái)的女警新人竟然就是千葉警官的初戀情人淼子，知道這些的柯南等人順?biāo)浦圩屒~和淼子一起調(diào)查此案，想要借此機(jī)會(huì)讓遲鈍的千葉回想起來(lái)，而在兩人調(diào)查的地下停車場(chǎng)內(nèi)卻發(fā)生了追撞事故，而這次事故似乎與紅色噴漆事件有著關(guān)系。

柯南用收據(jù)做出的特殊暗號(hào)被貓咪帶去保羅咖啡廳的時(shí)候被風(fēng)吹走了，在冷柜的他們情況很不樂(lè)觀，不能坐以待斃的他們又更改了送往阿笠博士家蛋糕的收獲地址，察覺(jué)到異樣的昴先生郵寄手機(jī)給貨柜里的柯南，但這一手法卻被犯人發(fā)現(xiàn)了。讓柯南沒(méi)有想到的是，前來(lái)解救他們的竟然是看到特殊暗號(hào)收據(jù)的波本。