柯南在調(diào)查橘律師釣魚的小船之后發(fā)現(xiàn)可疑的痕跡和莫名遺失的船錨。之后衫村小姐說(shuō)出熊田達(dá)也事情的真相。在看到約翰的狗屋的牌子之后柯南發(fā)現(xiàn)了兇手的身份。利用小五郎的沉睡，柯南向眾人闡述了兇手利用潮水漲落的犯罪手法和殺害熊田達(dá)也的發(fā)法。而兇手也主動(dòng)承認(rèn)了罪行并道出了殺人的理由。

小五郎的事務(wù)所里來(lái)了一個(gè)叫春菜的大學(xué)生，委托小五郎找他的尋呼機(jī)朋友。春菜保存了秋悟先生的尋呼機(jī)和音樂(lè)盒，那以后，春菜的尋呼機(jī)上出現(xiàn)了奇怪的留言。小五郎一行找到秋悟的家人，卻發(fā)現(xiàn)秋悟在給春菜送出尋呼機(jī)之前就已經(jīng)死了，而走廊上還出現(xiàn)了奇怪的人影。接著眾人就發(fā)現(xiàn)已經(jīng)被擊暈的阿稔。

和葉與服部帶小蘭他們游大阪的時(shí)候遇到了一個(gè)特殊的旅行團(tuán)，他們都是豐臣秀吉的崇拜者，因此在團(tuán)隊(duì)中大家都扮演不同的角色，但柯南等人卻惟獨(dú)沒(méi)有見到“豐臣秀吉”。然而沒(méi)過(guò)多久，有個(gè)人滿身是火的從天守閣上墜落死亡，而此人正是旅行團(tuán)中的“豐臣秀吉”，服部和柯南在尸體周圍找到了碎片和一個(gè)卷軸，這時(shí)，和葉說(shuō)這和十三年前發(fā)生的焦尸案一樣，雖然沒(méi)有什么頭緒，但柯南和服部斷定這一定和豐臣秀吉的寶藏有關(guān)。

柯南和小蘭一行人受到園子的邀請(qǐng)，來(lái)到山里的度假小屋吹度山莊制作巧克力，正巧碰到了準(zhǔn)備進(jìn)入森林尋找日本野狼的新聞?dòng)浾叨搅孙h雪的時(shí)候他還沒(méi)有回來(lái)，柯南和旅店的其他客人一起進(jìn)入森林去尋找，然而找到的卻是陳尸雪地的二垣的尸體，他臉上的血跡被人擦掉，太陽(yáng)眼鏡也被調(diào)整過(guò)，更奇怪的是在他的身旁還放置了亞子的巧克力。

柯南在從大阪回來(lái)的新干線中遇上了佐藤警官、高木警官。兩人正在押送毒品的秘密販賣者小倉(cāng)。途中車內(nèi)發(fā)現(xiàn)可疑的炸彈包裹。就在佐藤前去查看之時(shí)留下高木警官的時(shí)候，犯人小倉(cāng)要求去廁所，卻在廁所中用刀刺自己的腹部身亡。而在調(diào)查的過(guò)程中佐藤發(fā)現(xiàn)小倉(cāng)血跡的疑點(diǎn)，并推斷出這是他殺時(shí)間而非自殺。