建太去撿球時(shí)透過(guò)窗戶(hù)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)人身受重傷靠在沙發(fā)上，待大家發(fā)現(xiàn)后檢查傷者已經(jīng)死亡。柯南不認(rèn)為這是起意外事件，因?yàn)榭蛷d里還躺著另外一名死者。經(jīng)警察調(diào)查后得知受傷死者是房地產(chǎn)老板河合信藏，躺在地上的死者是河合以前的員工名叫柴田健介。柴田因挪用公款被河合開(kāi)除，警察推測(cè)這可能是柴田的殺人動(dòng)機(jī)。事件發(fā)生時(shí)河合的妻子優(yōu)子正在家中二樓睡覺(jué)，沒(méi)有聽(tīng)到樓下的打斗聲，這件事讓柯南起了疑心。

早上，米小圈父親和媽媽商量老家一個(gè)親戚二叔病了，他身邊無(wú)兒無(wú)女生活非常不方便，媽媽同情地說(shuō)可以接來(lái)照顧幾天，媽媽這句話(huà)正中爸爸下懷，他立刻去收拾雜物室，看到爸爸這么積極，媽媽知道又上當(dāng)了。姜小牙給米小圈看自己新得到的自行車(chē)，米小圈羨慕得不行，姜小牙說(shuō)這輛自行車(chē)是他爺爺送的，另一個(gè)同學(xué)鐵頭也說(shuō)他爺爺為他買(mǎi)了一個(gè)大榴蓮，可好吃了，米小圈又羨慕得不行，什么時(shí)候他爺爺也能送這么多禮物啊！終于下午回到家，米小圈看到二大爺回來(lái)了，他興奮地將二爺爺接到自己臥室住，看著兒子如此善解人意，米小圈的父親非常高興，覺(jué)得孩子終于能夠尊老愛(ài)幼了，母親不以為然，她覺(jué)得米小圈心里一定又在打什么壞主意。果真晚上，米小圈給爺爺錘完腿后，故意指著電視上的兒童自行車(chē)，問(wèn)爺爺知不知道他缺什么，爺爺點(diǎn)點(diǎn)頭，第二天，爺爺在學(xué)校附近無(wú)意中看到孫子羨慕地摸著別的同學(xué)的自行車(chē)，被同學(xué)無(wú)情嘲笑，他拉著孫子說(shuō)回來(lái)爺爺也給你買(mǎi)一輛。爺爺?shù)脑?huà)讓米小圈無(wú)比高興，激動(dòng)地一下午耳朵都嗡嗡直響，到了晚上，天色很晚了，米小圈一臉憧憬地來(lái)到樓下等著看爺爺給他買(mǎi)的自行車(chē)，等了好久，等到花都謝了，終于看到了爺爺?shù)挠白樱仔∪εd奮地跑上前問(wèn)爺爺新自行車(chē)在哪里？

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫(huà)線(xiàn)，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開(kāi)玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒(méi)，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門(mén)，眾人合力打開(kāi)門(mén)后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

根據(jù)死者背包中的贓物，秀一判斷該死者可能是一名搶劫犯，同時(shí)他發(fā)現(xiàn)還有一名嫌疑犯在逃。柯南在秀吉的幫助下帶來(lái)了三名有作案嫌疑的游客，經(jīng)過(guò)秀一的推理，真相很快浮出水面，警方也順利抓獲了犯罪嫌疑人。至此，柯南終于回憶起十年前與世良初次相遇的情景，同時(shí)他也意識(shí)到，世良可能已經(jīng)知曉自己的真實(shí)身份。

找到失蹤的貓咪后小五郎和柯南拿著酬勞準(zhǔn)備去吃飯，但他們卻突然聽(tīng)到尖叫的聲音，在樓下他們發(fā)現(xiàn)一對(duì)夫妻死在了家里。死在客廳里的是身中數(shù)刀的前原圣一，而他的妻子前原早紀(jì)則被捆綁在臥室的衣櫥里窒息死亡。警方探查之后認(rèn)為殺死圣一的正是他的妻子早紀(jì)，想要掩人耳目而把自己捆起來(lái)關(guān)入衣櫥的早紀(jì)卻遇到了意外，但真相真是這樣嗎？