紀曉嵐夜讀時又接到被扔進窗子的紙條，上面寫有郭天的消息，紀曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀曉嵐夜探郭天，得到通報的和珅與盧焯眼見沒有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過盧安，再見機救出瑤琴。紀曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調查國庫虧空一案。紀曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫，以自己掌握的情況博得宋司庫信任，并抓住其惶恐的心理，以消災為由取得真賬本。和珅模不透紀曉嵐葫蘆里賣的是什么藥，便決定先下手為強，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認罪，卻沒料到乾隆在盧安即將動身時救出瑤琴。

和舉報，當鋪與古玩店的老板均是一人，為陳輝祖的娘舅，紀曉嵐心知肚明其兩面派的手法，免不了又要動用鐵齒銅牙，大打口仗。 王斬柱秘密與紀曉嵐接頭，告之藏有真實帳本的地址。小月、莫愁依照紙條上所寫上下左右尋找，與領兵圍堵的和撞個正著，雙方就誰有資格扣留帳冊爭執不休，神出鬼沒的紀曉嵐與之交涉結果是各讓半步。 陳輝祖被停職，詆死賴帳，大喊無辜，和作出一副悲天憫人的假相，一換皇上定案，卻又趕緊掉轉風頭，大唱贊歌。 紀曉嵐敦促皇上嚴厲執法，不要輕易放過任何巧取豪奪的作偽官員，和則為貪污行為作了一通令人膛目結舌的辯論，二人每每想見，總少不了明爭暗斗，是天生的冤家對頭。 皇上傳旨，陳輝祖罪有應得，落個身首異處的下場。 杭州百姓抗糧舉事起義，紀曉嵐要小月慫恿皇上再度親訪，以體查民間疾苦。三人欣然而往，途中所遇貧民不斷控訴縣衙強迫大家在災年減產的情況下又加收二成軍糧的惡行。

紀曉嵐到街上散心，遇到j女騷擾，并被冠以浪蕩的名銜。紀曉嵐找皇上，要求替小月做媒，碰到來給皇上送古董的和珅。皇上答應了紀曉嵐的請求，提出交換條件卻欲言又止，和珅不由心虛。原來盧焯家丁被殺是皇上派人所為，由于沒找到和珅與盧焯結黨營私的證據，乾隆再下密令，要求殺手去盧府盜取盧焯的賬目。和珅路過盧府聽聞賬目被盜，讓盧焯不要聲張，以免露出破綻，卻被盧焯告知被盜走的是假賬目，和珅釋然。小月得知皇上已同意為自己做媒，不禁很是失望，小月扮成淑女模樣，倒讓紀曉嵐深感不適。和珅看昆曲時，遇到了美艷的坤角張了了，猛然想起算命先生說紀曉嵐命犯桃花，于是讓張了了引誘紀曉嵐，張了了無奈應允

軍豪不愿見到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國為名，表示愿放棄兒女之情，并險些喝下墮胎之藥。幸虧紀曉嵐以三寸不爛之舌，說服她靜待時日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀曉嵐難得默契合作，強行挽留住了他的腳步。 中秋佳節，皓月當空，卷帙浩樊的《四庫全書》編纂工作大功告成，皇上應邀來閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動產，生死攸關，太后以過來人的經驗竟擔當起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復蘇，破天荒地承認了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經曲折的姻緣終于名正言順，成為事實。 皇恩浩蕩，軍豪恢復狀元名號與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結為夫妻。勞苦功高的紀曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀曉嵐敲打，天下的不平之事由紀曉嵐主持公道……"

京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。