鷹取嚴男在取回寶石后將柯南扔在了馬路中間的綠化帶中，柯南受不住沖擊昏了過去，當他醒來時鷹取早已不見蹤影。柯南隨后被送到醫院檢查，所幸身體沒有受傷。柯南想弄清案件的真相，趁病房沒人偷溜出去尋找線索。他先去尋找之前在鷹取身上發現的酒吧地址，在酒吧隔壁的房間里竟然發現了被盜珠寶店的采購員的尸體。

高木警官突然來電要找柯南，他說柯南是殺人事件的知情人。畫家北園青峰下午三點半左右在家被人殺害， 警方為了確定嫌疑人之一北園先生的弟子西山大樹的不在場證明把柯南叫來，因為事發當日西山將柯南和朋友們作為模特畫了一幅風景畫。北園先生的兩位弟子和妻子都似乎與北園先生有過糾紛，這次的案件讓警察們陷入困局。

柳龍和蕭塵宇找到唐三和小舞，柳龍對唐三出言不遜，唐三使出控鶴擒龍的絕招襲擊柳龍，他疼地大呼小叫，蕭塵宇假惺惺向小舞賠罪，要把小舞帶回去當寵物兔養，小舞剛想發作，唐三急忙攔住她。蕭塵宇逼唐三把小舞交出來，然后加入他的武社，唐三斷然拒絕，蕭塵宇下令活捉那只幼小的斑斕貓，沒等柳龍出手，唐三炮突然出現，后面緊跟一條曼陀羅蛇，把蕭塵宇和身邊的侍衛打得七零八落，小舞趁機攙著唐三逃走。玉小剛突然出現，讓唐三和小舞跟緊他，以免再遇到麻煩，小舞一心想回去救那只受傷的斑斕貓，玉小剛勸她趁早死心，他發現斑斕貓被曼陀羅蛇咬傷，就順著痕跡找到蛇的巢穴，讓唐三炮把蛇激怒，引到了蕭塵宇他們身邊，才讓唐三和小舞得以脫身。玉小剛覺得這條曼陀羅蛇很適合唐三，讓他把蛇殺死吸取魂環，小舞提出質疑，唐三對玉小剛深信不疑。玉小剛想等蕭塵宇和蛇兩敗俱傷的時候出手，蕭塵宇和柳龍漸漸不敵，他們嚇得落荒而逃，曼陀羅蛇突然襲擊了玉小剛，玉小剛讓唐三出手殺蛇，唐三上下翻飛，使出暗器鐵釘襲擊蛇，結果被打翻在地，唐三使用紫金魔瞳刺瞎蛇的眼睛，然后再用鐵釘刺穿了蛇的喉嚨，曼陀羅蛇應聲倒地死亡，頭頂上現出黃色的魂環，唐三知道這條蛇至少有400年的法

這天，下課了，米小圈看到平時活潑的劉凱竟然坐在自己的座位上折紙，他好奇過去慫恿劉凱一起來玩，劉凱傷心地說他家破產了，爸爸以前總是特別忙，現在賦閑在家好幾天了，并且很多天都沒有吃肉，現在他也只好折紙盒兼職做外快。看到劉凱那么難過，米小圈也忍不住心酸。晚上，米小圈看到家里餐桌上只有一只雞腿，母親在啃生蘿卜，父親在喝蔬菜汁，想到白天劉凱的遭遇，忽然也有種預感，難道他的爸媽也破產了！晚上，米小圈和劉凱通電話，將他家的伙食情況告訴了劉凱，小伙伴斷定他家真的破產了。為了幫助爸媽分擔，第二天上學，米小圈和小朋友商量怎么幫助爸媽度過經濟危機，他的小伙伴建議這世界一本萬利的方法就是用自己的腦子賺錢，他們決定可以用出租漫畫書的方式，這星期三個人忙壞了，終于賺了一百塊錢。有了人生第一桶金，米小圈和鐵頭興奮地憧憬著如果全校同學都來借他們的漫畫書會掙到更多，不久，鐵頭接到一份大單，有人要租全部的漫畫書，米小圈和鐵頭興奮了整整一上午，終于去到約定的時間，對了暗號，沒想到被班長李黎給抓了包。所有漫畫書也被班主任老師扣到了辦公室。晚上，米小圈回到家，看到爸媽依然把最好的食物推到他面前，媽媽繼續啃胡蘿卜，父親僅僅喝了一

利用步美找到的暗號解讀表，柯南本以為能順利解開暗號，不料卻遇到了瓶頸。正當此時，若狹老師再次拜托少年偵探團前往舊倉庫尋找石灰。來到舊倉庫的眾人發現倉庫一片狼藉，在若狹老師不經意的提示下，柯南終于解開了暗號的含義，并推測犯人將再次來到舊倉庫。為了避免打草驚蛇，柯南設計誤導犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來到舊倉庫，柯南能否順利將犯人一網打盡？