柯南們?nèi)⒂^步美發(fā)現(xiàn)的可愛的新房子。從閣樓的天窗可以看到毛利偵探事務(wù)所的一部分。2天后柯南們從步美那聽說(shuō)，那個(gè)房屋賣掉了。據(jù)說(shuō)買主是一對(duì)70多歲的老夫婦。而在柯南他們認(rèn)識(shí)那個(gè)房屋里的老太太之后，偷拍在事務(wù)所吃晚飯的柯南們的人物也出現(xiàn)了，竟然是住在閣樓的家的老夫婦！而柯南也最終發(fā)現(xiàn)了老夫婦的真實(shí)身份。

柯南和光彥等人在放學(xué)的路上遇到了警察辦案，詢問得知，一個(gè)叫江上的婆婆被自己家陽(yáng)臺(tái)的花盆意外砸死，鄰居們都把江上稱為“烏鴉婆婆”，她曾偶然在垃圾堆里翻出中獎(jiǎng)券，于是便常常去翻垃圾窺探鄰居的隱私，而招致大家的反感，就在警方想以意外事件結(jié)案時(shí)，柯南察覺到從樓頂?shù)粝聛?lái)的花盆很奇怪，經(jīng)過調(diào)查，他認(rèn)定這是一起蓄意殺人事件。

大家找到校長(zhǎng)詢問他下雨的時(shí)候是否出現(xiàn)在操場(chǎng)，沒想到卻得到了否定的回答，為了證實(shí)校長(zhǎng)的說(shuō)法，柯南又來(lái)找了在保健室休息的世古國(guó)繁，因?yàn)樗c保坂從小一起長(zhǎng)大，所以又了解了更多關(guān)于保坂的事情，這時(shí)，小蘭在走廊的木板上發(fā)現(xiàn)污漬，柯南將這些污漬與操場(chǎng)上出現(xiàn)的刮痕相聯(lián)系，沒錯(cuò)，制造靈異事件的就是那個(gè)人!

除了發(fā)現(xiàn)煙頭，柯南還發(fā)現(xiàn)二川身上多處沾有血跡，博士等人也在懸崖上找到了寫有遺書的手機(jī)，回到旅館后柯南將這件命案告訴了其他人，就在大家根據(jù)二川留下的遺書認(rèn)為他是自殺時(shí)，柯南卻說(shuō)他是被人用鋼管擊中頭部墜落山崖而死，于是少年偵探隊(duì)便對(duì)其他三個(gè)可疑人的房間進(jìn)行檢查，雖然一無(wú)所獲，但柯南還是發(fā)現(xiàn)了蛛絲馬跡，他讓灰原配合他演戲，沒想到真的有人上鉤，這個(gè)人就是真兇嗎？

柯南和小蘭跟著小五郎一起來(lái)到鹿兒島，隨后三人就立即就去拜訪一個(gè)叫高隈的制酒廠，酒廠老板娘白石扶美子帶著這三人四處參觀的時(shí)候，卻不幸發(fā)生了意外，大家在董事辰村慎介的家中發(fā)現(xiàn)地上留有一灘血，而他本人也知了去向，經(jīng)過兩天的尋找辰村的尸體在公園里被人發(fā)現(xiàn)，而酒廠的所有人都成了此次案件的嫌疑人。