阿笠博士帶著少年偵探團(tuán)一起去參觀西田在家里建造的水族館時，遇到了旅行回來的西田的學(xué)生井村，他們用備用鑰匙進(jìn)了房子，沒想到光彥和元太竟然在廁所的浴缸里發(fā)現(xiàn)了西田的尸體，柯南注意到了死者脖子上的針孔、手指上的粘著劑、關(guān)閉的浴室電燈，并且還在步美的提醒下看到了水族箱里死去的蝦，這種種跡象表明西田是被人蓄意謀殺的，可是警察確認(rèn)為這是意外事件，就在他們準(zhǔn)備結(jié)案時，柯南說出了真相！

警方在將這三個嫌疑人分開偵訊之后，又在死者的包里發(fā)現(xiàn)了一把手槍和強(qiáng)盜集團(tuán)百鬼夜行留下的字條，并從小島權(quán)作的秘書那里得知，他舉辦此次活動是為了尋找殺死自己愛犬的同叫小島的強(qiáng)盜頭目，于是柯南利用與死者相同的方法找出兇手，雖然證據(jù)被銷毀，但他巧施妙計讓兇手自己主動承認(rèn)了罪行。

灰原要求查看電視臺在黑暗中拍攝的影像，然而除了電流被切斷的聲音和風(fēng)聲并沒發(fā)現(xiàn)有任何異樣，就在案件找不到頭緒時，大人們便開始互相懷疑，這時，柯南蘇醒過來，但是他讓元太他們對此事暫時保密，根據(jù)基德在臺座上貼的卡片，柯南知道了右衛(wèi)門刻在柱子上的話以及基德的真身，他讓少年偵探團(tuán)戳穿他的身份，這一次基德能否成功脫身？

園子的次郎吉叔祖父要舉辦龍馬展，而怪盜基德則發(fā)出了預(yù)告狀。但奇怪的是這次基德發(fā)出的是歸還物品的預(yù)告狀！而從叔祖父那里園子他們了解到這次次郎吉只是借出了博物館場地，而展覽的主辦發(fā)則是樽見。為了對抗基德，幾次郎在展覽場地安排了特別“基德歸還處”就在眾人在處處提防怪盜基德的時候柯南發(fā)覺了基德指定的日期是雨天。但基德的用意究竟何在？

柯南、小蘭和小五郎在咖啡廳結(jié)識了一名叫高畑響子的女士，她從警察那里得知的妹夫福島意外死亡后就匆忙趕回家中，現(xiàn)場除了尸體還有散彈槍和墜落的吊燈，警察準(zhǔn)備以意外事件結(jié)案，但身為死者同學(xué)的千葉警官卻認(rèn)為事情沒有那么簡單，他和同樣持有懷疑態(tài)度的柯南暗自展開了調(diào)查，不出所料這果然是一起有預(yù)謀的殺人事件！