馬謖不聽王平的當道扎營之策，執意屯兵于山上。司馬懿派張郃阻攔王平，自己派兵防守水道，圍山放火。諸葛亮（唐國強飾）看到王平繪制的街亭地圖及軍事布防，悲憤不已，并猜到了司馬懿的戰術，速派楊儀出兵匯合王平解救馬謖。楊儀半途接報街亭失守。諸葛亮聞訊知大勢已去，命將士們準備回漢中。諸葛亮搬運糧草之時，司馬懿率大軍瀕臨城下。諸葛亮撫琴于空城之上，并大開城門。司馬懿聽琴觀勢，誤以為諸葛亮設下埋伏，慌忙撤離，再回來時對諸葛亮之計佩服不已。諸葛亮拒絕三軍將領的求情，依軍法，斬了馬謖，悔恨自己沒聽劉備（孫彥軍飾）遺言不可重用馬謖，自降職務，休整蜀軍，以備伐魏。諸葛亮欲伐魏之時，得知趙云辭世，悲痛不已。

孫權（吳曉東飾）按照周瑜（洪宇宙飾）之計，多送劉備美色與庭院，讓他享盡榮華富貴，以待時機奪回荊州。遠在荊州的關羽（陸樹銘飾）、張飛（李靖飛飾）終于坐不住了，面見諸葛亮問（唐國強飾）其原因，諸葛亮早已算定劉備年初必歸。趙云拿出諸葛亮的錦囊，依其中計策，以曹操攻打荊州為由，催促劉備即刻趕回荊州。劉備帶孫尚香逃回荊州，孫權派大軍掩殺，孫尚香得知自己只是孫權奪回荊州的工具，便親自開路帶劉備逃出了東吳領地。諸葛亮派船前去迎接劉備，劉備最終平安返回荊州。周瑜則吐血倒地。

魏王病逝，曹丕（楊俊勇飾）繼位，曹彰率十萬兵馬前來奔喪，曹丕知道來者不善，派賈逵為說客，設計收繳曹彰兵馬。十月，曹丕逼漢獻帝退位，封漢獻帝為山陽公，自稱大魏皇帝。漢中王劉備（孫彥軍飾）聞知漢獻帝被逼死，痛苦終日，憂慮成疾不能理事。諸葛亮（唐國強飾）與眾臣商議，言天下不可一日無君，奏請劉備繼位。諸葛亮故此托病不出，劉備前來探望，諸葛亮借此勸得劉備繼帝位。建安二十六年四月，劉備稱帝于成都，改年號為章武。元年七月，為報關羽被害之仇，劉備下命率兵七十萬攻東吳。

徐庶在去曹操（鮑國安飾）陣中的路途中特意折返回劉備陣中舉薦諸葛亮。徐庶來到曹操營中，徐庶老母痛斥徐庶不該因為自己而為漢賊效力，之后悲憤自殺。徐庶自此發誓終生不為曹操獻一計一策。劉備（孫彥軍飾）求賢若渴，即刻啟程去尋諸葛亮（唐國強飾），不料第一次拜訪未遇其人。

魏軍與蜀軍交兵于祁山，司馬懿（魏宗萬飾）屢次中計，于是閉門不出，以逸待勞。劉禪恢復了諸葛亮丞相的職位，但這時諸葛亮的身體已經大不如前。諸葛亮設計引魏軍出戰，司馬懿與諸葛亮斗智斗勇，知道這是諸葛亮的誘敵之計，于是分兵兩路夾擊蜀軍，諸葛亮也做好了周密的部署，分兵四路對抗魏軍。此時魏延（王心海飾）已經有了反心。魏軍慘敗。諸葛亮卻重病倒下，全軍撤回漢中。一年后魏軍率兵四十萬直逼漢中，諸葛亮訂下退敵之策準備再出祁山。連降秋雨，魏軍冒雨而退，諸葛亮乘勢再出祁山。