警方、柯南以及公車(chē)上遇到過(guò)的偵探世良真純一起進(jìn)入別館進(jìn)行調(diào)查，他們?cè)诙前l(fā)現(xiàn)了帶有釣魚(yú)線的電動(dòng)輪椅，在死者墜落的六樓發(fā)現(xiàn)了窗戶(hù)下方的油漆和油桶，加之別館使用的是前后各有一扇門(mén)的電梯，將這些線索全部串聯(lián)起來(lái)之后，柯南發(fā)現(xiàn)兇手就是那個(gè)人！世良先柯南一步破解案件并場(chǎng)景重新，然而結(jié)果卻并非大家所期待的那樣，人偶并沒(méi)有墜樓，到底是哪里出現(xiàn)了錯(cuò)誤？

阿笠博士住在鄉(xiāng)下的老友龍?zhí)赡抢飫偤糜性麄兿胍纳钌介毙蜗x(chóng)，在柯南等人捉蟲(chóng)回來(lái)時(shí)卻發(fā)現(xiàn)龍?zhí)纱笫宓乖诹说厣希T(mén)口的佛像也不翼而飛，再留下“深山楸形”幾個(gè)字后龍?zhí)杀銜灹诉^(guò)去。與龍?zhí)捎型恋剡吔鐔?wèn)題糾紛的周平和時(shí)常會(huì)偷盜佛像的慶都因與“深山楸形蟲(chóng)”有關(guān)系而被懷疑，經(jīng)過(guò)調(diào)查而前往道之站的柯南認(rèn)為兇手另有其人。

現(xiàn)場(chǎng)的鄰居是前男友（前篇）

在小蘭的跆拳道社學(xué)姐鏡堂奈奈美的邀請(qǐng)下，少年偵探團(tuán)的眾人來(lái)到了鏡堂家尋找傳聞中的寶藏，非常熱衷建筑的上一代家主鏡堂征太郎在這座宅邸中設(shè)下了各式各樣的機(jī)關(guān)，而沒(méi)有入口和窗戶(hù)的暗黑之塔也是其中之一，而在奈奈美帶領(lǐng)他們?cè)谡∷奶巺⒂^時(shí)突然聽(tīng)到了女性的慘叫聲，奈奈美的母親不幸從塔上墜亡，前去調(diào)查兇手的途中灰原卻不見(jiàn)了蹤影。

為了查出監(jiān)禁高木警官的地點(diǎn)，警方持續(xù)搜查的時(shí)候三位關(guān)系者漸漸浮上臺(tái)面，鎖定了可能是嫌疑犯的人后警方馬上進(jìn)行潛入，雖然向嫌疑人澄清了事件的真相，但早已服毒的嫌犯在沒(méi)有說(shuō)出監(jiān)禁地點(diǎn)的情況下死亡。另一方面，好不容易掙脫了雙腳束縛的高木警官丟下了腳邊的布后卻發(fā)現(xiàn)了綁在木板下的定時(shí)炸彈。