受到服部的邀請，小五郎、小蘭和柯南前往大阪參加一個名為3K餐廳的開幕酒會，餐廳老板是前職業(yè)拳擊手里卡巴雷、美國職棒投手邁克諾德和柯南的偶像職業(yè)足球選手雷卡迪斯三人，沒有想到就在柯南等人協(xié)助他們進行一場秘密計劃的時候，槍聲突然響起，柯南和服部匆忙趕到發(fā)出槍聲的房間，發(fā)現(xiàn)美國報社記者埃德麥肯竟然被人槍殺橫尸屋內(nèi)，警方立刻對所有來賓進行排查，另一邊服部發(fā)現(xiàn)柯南的表現(xiàn)很反常。

打算盜取鈴木財閥家的黑珍珠BLACK STAR的怪盜基德，想起了以前關(guān)于鐘臺的一個事件，那是工藤新一和怪盜基德的第一次交手。另一方面，小五郎的事務(wù)所里收到一封附有支票的不明發(fā)信人的信函，并且在其上方還有一行奇怪的話語。

茂木認為小五郎是兇手而開槍將他射傷，當(dāng)前來“黃昏別館”的所有名偵探都命喪黃泉時，電腦上居然出現(xiàn)了一行關(guān)于寶藏的信息，一直躲在監(jiān)視器操控室的神秘幕后黑手終于按捺不住露出了真面目，沒想到這個人居然是……柯南引導(dǎo)她說出了整件事的真相，而這時，本應(yīng)死去的偵探們居然都出現(xiàn)在門口，可到底是怎么回事？這棟別墅的寶藏又是什么？

小五郎等人在去海豚樂園的路上，遇到了幾位正在進行大學(xué)同學(xué)聚會的女子。為了接另一位大學(xué)同學(xué)，他們一起前往海豚樂園飯店卻意外發(fā)現(xiàn)她們等待已久的藤村直美被殺害了。經(jīng)過調(diào)查之后柯南確認了兇手的身份并向大家演示了兇手利用雪糕的犯罪手法。再自己留下的證據(jù)面前，兇手最終承認了罪行。

柯南等也到同一個餐廳吃飯，聽說與這幾個漁夫相約的人在海邊溺死了。伊豆海邊發(fā)生了殺人事件。柯南已經(jīng)確認了犯人的真實身份并利用因為泡到海水里無法確定死亡時間這個baga套出了犯人的話，面對現(xiàn)實，犯人最終承認了自己的罪行。因為殺死了自己的父親而懷恨在心，最終痛下殺手。但自己的這番行為卻得不到同伴的贊同發(fā)怒的兇手最終在小蘭的話語中認識到自己的錯誤。