在宅急便送圣誕蛋糕到阿笠博士家前，柯南等人在公園踢球消化腸胃，途中為了追把保羅咖啡廳當(dāng)做根據(jù)地的貓咪，他們不小心被關(guān)進(jìn)了宅急便的配送冷藏車內(nèi)。想辦法離開(kāi)的他們看到了貨柜里的尸體，打算向外界求救時(shí)手機(jī)又恰好沒(méi)電，拿出手邊所有東西的他們準(zhǔn)備想辦法向外界求助。

以幕末的長(zhǎng)崎為舞臺(tái)，有坂本龍馬擔(dān)任的偵探而活躍的推理劇，正在負(fù)責(zé)寫腳本的編劇家耕作先生突然消失蹤影，只寫了一半的劇本則委托小五郎先生幫忙推理出劇中的真正犯人，調(diào)查了耕作房間的柯南等人發(fā)現(xiàn)了許多古董美術(shù)品竊盜團(tuán)的簡(jiǎn)報(bào)，這一切似乎都有著隱情。失蹤中的耕作先生利用郵件將后續(xù)的劇本傳送過(guò)來(lái)，在劇本中出現(xiàn)了奇怪的臺(tái)詞。

繼輕井澤別墅中的若松先生遇害之后，他的兒子玉郎也在東京的家中被毒殺，不可思議的是除了玉郎吃掉的那塊蛋糕意外并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)其他的蛋糕上有毒。于此同時(shí)，大和敢助警官等人注意到了被殺害的若松先生浴室的瓷磚是運(yùn)用了一種名為陰影鉆石錯(cuò)視的會(huì)引發(fā)視覺(jué)錯(cuò)覺(jué)的形狀，總算讓若松社長(zhǎng)的死亡訊息再次顯現(xiàn)出來(lái)，而現(xiàn)實(shí)出的字母竟是SON。

與服部一起來(lái)到東京的和葉在家庭餐廳買真空包裝咖喱時(shí)遇到了殺人事件，世良真純提議讓西部偵探代表服部與工藤借此機(jī)會(huì)進(jìn)行一場(chǎng)推理對(duì)決。趕到案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)之后，柯南、服部等人見(jiàn)到了第一個(gè)發(fā)現(xiàn)死者的卡梅隆警官，目前死者的身份無(wú)法確定，唯一的線索就卡梅隆曾聽(tīng)到過(guò)的死者疑似自殺的話，得知死者帶有關(guān)西口音后，服部推斷出兇手就在這家餐廳。

高木警官完全沒(méi)有向任何人告知行蹤便獨(dú)自出了遠(yuǎn)門，在警視廳門前等待高木警官的少年偵探團(tuán)們遲遲等不來(lái)人，這時(shí)一個(gè)男人交給了他們一個(gè)說(shuō)是高木警官送來(lái)的包裹。佐藤警官打開(kāi)包裹后發(fā)現(xiàn)里面放著一個(gè)平板電腦，按下電源后看到的竟然是身處于危險(xiǎn)之中的高木警官，即便高木警官還保持著冷靜，但體力透支的他還能撐多久？