玉真子從皇宮中得到一柄削鐵如泥的寶劍，于是決定單劍獨挑華山派，木桑攔阻玉真子，幾乎喪命在玉真子掌下，幸虧阿九舍命相救。袁承志及時趕到，大戰玉真子。兩人決戰紫禁之巔。玉真子的寶劍和袁承志的金蛇劍足以匹敵，雙方不相上下。最后袁承志在搏斗中成功地悟出金蛇劍的奧秘，殺死玉真子。華山派重立掌門，黃真接位，何鐵手也入了華山派門墻。袁承志將自己心中的憤懣向師傅稟告，但是師傅也無法給出他一個明確的答案。

何紅藥布置陷阱，下毒暗害，欲捉青青，結果被袁承志挫敗，沒有成功。何鐵手責備何紅藥打草驚蛇。何鐵手與左右護法齊云璈、何紅藥商議，從袁承志的武功可知他正是金蛇郎君的傳人，而五毒教的三寶也在他的手上，（金蛇劍、金蛇錐、藏寶圖）必須要奪回三寶，最后何鐵手決定，劫奪金蛇郎君的女兒，先換回三寶再徐圖后計，何紅藥大喜叫好！得知袁承志是七省武林盟主，金蛇營主帥時，惠王若有所思，反而說了句，這么年輕，這么好的武功，只可惜了他的出身。

袁孫仲壽等人已知阿九公主身份，提醒袁承志不可忘記復父仇、殺崇禎的大義。要袁承志揮劍斷情絲。袁承志點頭答應眾人。京城庫銀接連被盜，崇禎震怒。眾公差無法破案交差。請出已退休的單鐵生。單鐵生一方面請自己的好友安劍清幫忙查案，一邊自己悄悄在京城查訪。發現袁承志等人進京。他誤以為此事乃袁承志等人所為。故想送禮請求眾人高抬貴手，給眾公差一口飯吃。袁承志表明，并非自己所為。袁承志和青青前去法場拜祭父親，痛哭一場，更下定殺崇禎、報父仇的決心。

在宮中，袁承志發現了何鐵手的蹤跡，不想因為跟蹤她反而追蹤到了青青的蹤跡，為了探聽何鐵手等人陰謀的詳細步驟，袁承志鉆入青青的床底下。何鐵手與何紅藥為了如何處置青青引發了爭執，何鐵手離開后，袁承志讓洪勝海護送青青逃出宮去，自己則去引開追兵。不想被何鐵手追的慌不擇路，躲進一處寢宮。想不到此地正是阿九的寢宮。于是向阿九揭露了惠王的陰謀，阿九大驚，立刻起身要去護駕。袁承志猶豫片刻，終于決定與阿九同去。

袁承志沒有找到崇禎，惦念阿九，又回到宮中。此時的崇禎已經瘋狂，周皇后上吊，崇禎連連叫好，隨即又親手砍殺了幾個嬪妃，而趕來的女兒阿九不愿離開宮時，崇禎猜到阿九是在等袁承志，崇禎騙過金蛇劍，一劍砍斷了阿九的左臂。袁承志于此時趕到，救下阿九，他出手要殺崇禎，崇禎閉目待死，阿九大叫了一聲“不要！”袁承志放過崇禎，他抱了阿九，走出宮去。此時四野寂寂，袁承志心中百感交集，望著懷中的斷臂阿九，只想大哭一場！崇禎與太監王承恩自縊于煤山。