董卓見呂布戰敗，盟軍勢大，燒洛陽，逼獻帝遷都長安。盟軍入洛陽，各起異心。孫堅在宮井中得到傳國玉璽，率軍返回江東。曹操（鮑國安飾）與袁紹發生摩擦，去了揚州。盟軍瓦解。接著軍閥又開始火并。袁紹攻公孫瓚，被趙云所救。趙云（張山飾）本是袁紹部將，見袁紹無忠君救民之心，于是棄袁紹而投了公孫瓚，但不受重用。在江東，孫堅攻荊州，被劉表軍士用亂箭射死。此時，司徒王允在長安設下連環計，讓董卓和呂布為爭奪歌JI貂嬋而發生沖突，董卓被殺。董卓部將又反撲過來，殺了王允全家。在軍閥混戰中，青州黃巾又起，曹操前往收降了三十余萬人，擇精壯者編為青州軍，其余軍士放歸務農，從此威名大振，朝廷封曹操為鎮東將軍，屯駐兗州。這時，曹操老父被黃巾降將所害，操為報父仇，盡起兵馬親討降將新主徐州陶謙。劉備從公孫瓚處借趙云和兵馬解救陶謙，曹操因呂布助張邈奪取兗州而退兵，徐州解圍。陶謙三讓徐州，劉備終受，暫管徐州軍政事務。曹操與呂布混戰，收復兗州。

忍者學校的畢業考試就要開始了，筆試過后便是實技考試，各方面都很優異的博人很輕視這次的考試，他認為只要是考試就能輕松通過。實技考試開始了，監考老師有志乃、木葉丸和紅豆老師，而六代火影卡卡西也親自到場，雖然老師們展示出了前所未有的威壓，但過于自信的博人卻并沒有當回事兒。

白夜團的風波已經過去一周，七代火影接受采訪時對下忍們稱贊有加，在這期間因違反命令被關緊閉的巖部非常懊悔。中忍考試的消息讓巖部非常緊張，參加中忍考試需要帶隊老師的推薦，所以第五班的眾人打算在老師面前大展身手，碰巧火影安排給了他們新的任務，他們將參加忍者學校忍術科的招生宣傳紀錄片拍攝。

大筒木一族三人突襲中忍考試會場，目的是回收鳴人的尾獸查克拉重新種植神樹，煉制長生不老的丹藥。佐良娜險些被大筒木金武襲擊，佐助登場救女兒。鳴人被大筒木桃式一腳踢飛，博人用科學忍具接連反擊，力量卻被對方吸收據為已用。鳴人開啟九尾模式對抗大筒木，他守護村子的身影感化了博人。

在與花火的切磋中博人使出了全力，但直到最后也絲毫沒有開眼的跡象，博人開始覺得自己的這只眼睛可能并不是白眼。雖然博人并沒有開啟白眼，但鳴人可以肯定自己的兒子并沒有撒謊，博人可能擁有了白眼以外的某種力量。博人對著影正的電影海報喃喃自語時遇到了佐良娜，兩人談到影正的續篇可能會中止時神秘的黑影又出現了。