周瑜（洪宇宙飾）向魯肅等人安排一定要輔助主公成就大業，向孫權（吳曉東飾）推薦魯肅繼任己位。周瑜臨終前大呼“既生瑜，何生亮？”諸葛亮（唐國強飾）得知周瑜死訊，他說服劉備（孫彥軍飾）等人前去吊孝。小喬把周瑜佩劍贈與魯肅，魯肅得知諸葛亮來吊孝，派諸葛謹前去勸回，諸葛亮謝絕，執意要來。程普等人聞訊預謀殺害諸葛亮，魯肅向孫權表明心意，不可殺諸葛亮。祭祀之日，諸葛亮痛哭前來，甘寧拔劍刺向諸葛亮，趙云出劍擊落甘寧之劍。魯肅命程普等人住手，要善待嘉賓。諸葛亮雙手捧劍于程普面前，程普無奈接下。諸葛亮來到周瑜靈前，痛哭中訴說著周瑜一生的輝煌成就，自己也永遠失去一位知己。小喬說出周瑜遺愿：“孫劉交好，以抗曹操（鮑國安飾）。”權觀諸葛亮祭奠之情，對世間流傳公瑾與孔明不和之說不再相信。諸葛亮臨別時告訴魯肅退曹之策，魯肅謝過，感到諸葛亮多情，而周瑜度量太窄。諸葛亮遇見龐統，留給他薦書，希望他來荊州。龐統經魯肅舉薦去見孫權，孫權見他容貌古怪，未能重用。劉備見龐統前來，任他做縣令。三月后，張飛（李靖飛飾）前去視察，看龐統三月不理政事很是氣憤，后觀龐統斷案如神，便把他請回。劉備再見龐統表示慚愧，問諸葛亮為何不修書推薦，

魏軍與蜀軍交兵于祁山，司馬懿（魏宗萬飾）屢次中計，于是閉門不出，以逸待勞。劉禪恢復了諸葛亮丞相的職位，但這時諸葛亮的身體已經大不如前。諸葛亮設計引魏軍出戰，司馬懿與諸葛亮斗智斗勇，知道這是諸葛亮的誘敵之計，于是分兵兩路夾擊蜀軍，諸葛亮也做好了周密的部署，分兵四路對抗魏軍。此時魏延（王心海飾）已經有了反心。魏軍慘敗。諸葛亮卻重病倒下，全軍撤回漢中。一年后魏軍率兵四十萬直逼漢中，諸葛亮訂下退敵之策準備再出祁山。連降秋雨，魏軍冒雨而退，諸葛亮乘勢再出祁山。

諸葛亮（唐國強飾）奏請蜀王，再次伐魏。蜀軍攻打陳倉城久攻不下。姜維出計自己詐降曹真，誘其入斜谷擒之。曹真部下怕其中有詐，請命出戰，被擒獲。司馬懿出計可讓曹真鎮守要道，待蜀軍糧盡自退，并請魏王以詔書下之，恐有越俎代庖之嫌。曹真部下郭淮說此計出于司馬懿，日后只有他能抵御蜀軍。曹真聽罷很是不服，假借糧草誘蜀軍來劫，趁機偷襲蜀營。諸葛亮將計就計大勝魏軍。魏王派張郃去助陣曹真。魏延斬了陳倉守將，曹真聞之憂患成疾，回洛陽休養。司馬懿向曹睿解釋說東吳不會真來攻打魏國，只要小心蜀軍。曹睿得知蜀軍攻取陳倉，正逼近長安，便命司馬懿去退敵。司馬懿知道曹真對自己有成見，請求魏王不要直接授大都督之印，而是親自看望曹真，說蜀軍來犯，自己難擋重任，且言詞謙誠。曹真明白其意，也為不聽司馬懿之計深感愧疚，希望以國事為重，將大印交與司馬懿。司馬懿出計派兩名大將去解邊城之困，被諸葛亮猜到，敗退而歸。司馬懿又命張郃等夜襲蜀營，又被諸葛亮猜到。張郃殺出重圍，諸葛亮感嘆其勇。

興兵伐吳劉備因關羽之故，手足之情興兵伐吳，諸葛亮在阻止劉備無效。此時，張飛趕來，直言劉備忘了往日桃園結義之情，定要自己前往東吳報仇。劉備此時已經決意，要興兵掛孝伐吳。

七擒孟獲諸葛亮出兵南方，將當地酋長孟獲捉住七次，放了七次，使他真正服輸，不再為敵。比喻運用策略，使對方心服。