園子拉著小蘭和柯南去蛋糕博物館吃半價(jià)蛋糕，在這里每個(gè)師傅都有自己的廚房，參加比賽百戰(zhàn)百勝的前田、蛋糕王子藤野以及糖果魔術(shù)師森本都忙著為客人準(zhǔn)備甜點(diǎn)，期間，柯南還在藤野那里嘗試了做木頭蛋糕，就在藤野修飾好蛋糕拿給柯南吃的時(shí)候，店里卻發(fā)生了兇案，死者是蛋糕店長(zhǎng)橋垣，而嫌疑最大的就是這三個(gè)蛋糕師傅，但警方卻苦于找不到兇器，隨后柯南對(duì)每個(gè)人的廚房進(jìn)行調(diào)查卻發(fā)現(xiàn)……

應(yīng)社樂(lè)蓮希小姐的邀請(qǐng)，柯南等人來(lái)到音樂(lè)世家社樂(lè)調(diào)一郎的公館，蓮希拜托小五郎調(diào)查因名琴——斯托拉地巴力毆斯所引起了一連串詭異事件，然而，就在他們談?wù)摯耸聲r(shí)，旁邊的別館火舌繚繞，在那里小憩的弦三郎也因此喪生火海，大家又重回原來(lái)的房間，柯南卻發(fā)現(xiàn)了奇怪的煙蒂，在與火樓里的煙蒂對(duì)比以后，柯南認(rèn)定這并不是意外而是故意殺人，并且還將會(huì)出現(xiàn)下一個(gè)被害者。

在放學(xué)回家的路上，柯南、步美等人碰到了進(jìn)出珠寶店的高木警官，便一起跟了進(jìn)去，想不到在這里碰上了珠寶搶匪，于是，高木警官帶著柯南等人展開(kāi)了追捕，可追到屋頂時(shí)，搶匪竟然毫不猶豫的跳了下去，摔在了樓下的搬家貨車(chē)上而身亡。巧合的是這輛貨車(chē)的雇主貓?zhí)镎撬勒吆蟠宓睦习澹履细鶕?jù)搬家公司員工的說(shuō)法以及目擊者提供的零星線(xiàn)索斷定這是一起謀殺案件。

柯南、小五郎和小蘭一起到神話(huà)故鄉(xiāng)出云旅游，并在這里認(rèn)識(shí)了兩情相悅卻無(wú)法在一起的江角榮子和福間良介，次日，警察在豬目洞窟發(fā)現(xiàn)了江角的未婚夫鱷淵的尸體，經(jīng)過(guò)篩選，具有殺人動(dòng)機(jī)的有四個(gè)人，除去江角、福間還有藤江和石飛，有目擊者說(shuō)曾見(jiàn)過(guò)福間出現(xiàn)在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)，可福間卻對(duì)此沉默不語(yǔ)像是在保護(hù)什么人，而江角也和福間出現(xiàn)相同的情況，為證明二人的清白，柯南能找到什么樣的證據(jù)？

阿笠博士帶著少年偵探隊(duì)來(lái)到岡山縣倉(cāng)敷市展開(kāi)了一場(chǎng)古代史之旅，他們?cè)谶@里結(jié)識(shí)了因同學(xué)會(huì)而重新聚在一起的五名男女，然而就在大家按照撿來(lái)的暗號(hào)進(jìn)行尋寶時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)那五人中的一人突然死亡，另外一個(gè)則被當(dāng)做重要關(guān)系人接受調(diào)查，根據(jù)少年偵探隊(duì)所找到的時(shí)光保存罐以及死者留下的死亡訊息，柯南斷定兇手就在剩下的四人中，但要抓住真兇，就必須要找到其他兩個(gè)時(shí)光保存罐。