在幫純子小姐調(diào)查入室偷竊的時候小五郎和柯南遇到了一起命案，死者是純子小姐的鄰居北上先生，初步判斷為酗酒墜樓，但在高木警官調(diào)查附近鄰居時柯南看出了端倪。所調(diào)查的房間里柯南看到了幾處線索，這些都可以說明北上并非意外墜亡，但是柯南還是沒有找到關(guān)鍵的證據(jù)，小五郎在電梯里整理儀容時柯南突然明白了什么。

日賣體育記者加賀爪弘和橋爪明曾在一年前報道過一篇關(guān)于大企業(yè)老板角山制作所的山角雄三社長去世引發(fā)的遺囑失蹤事件，這兩位記者當時不斷煽風點火，將自己挖到的爭奪遺產(chǎn)的丑聞都刊登在雜志上害的親屬爭執(zhí)不斷最后甚至引發(fā)了殺人未遂案。柯南白天在餐館遇到了這兩名關(guān)系很差的記者，沒想到就在當晚，加賀爪弘竟然被發(fā)現(xiàn)在河邊遇害。

在被害人波土的遺物中發(fā)現(xiàn)了他親手所寫的字條，經(jīng)紀人和社長隨即回憶起了波土生前的往事，眾人這才得知經(jīng)紀人小姐原來竟是波土的前女友。而在舞臺上發(fā)現(xiàn)的繩索和折疊椅也為柯南等人提供了線索，經(jīng)過波本對繩索的一番講解和演示，眾人共同推理出了波土的死因和兇手的真實身份。

柯南等人來到方斗寺調(diào)查會預知未來的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內(nèi)留宿。正當眾人享用晚飯時，突然從房內(nèi)傳出一聲慘叫，原來是正在房中念經(jīng)的住持被人殺害。毛利小五郎通過柯南在院內(nèi)找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當兇手跪地坦白自己的罪行時，柯南突然發(fā)現(xiàn)案件并沒有結(jié)束……

根據(jù)死者背包中的贓物，秀一判斷該死者可能是一名搶劫犯，同時他發(fā)現(xiàn)還有一名嫌疑犯在逃。柯南在秀吉的幫助下帶來了三名有作案嫌疑的游客，經(jīng)過秀一的推理，真相很快浮出水面，警方也順利抓獲了犯罪嫌疑人。至此，柯南終于回憶起十年前與世良初次相遇的情景，同時他也意識到，世良可能已經(jīng)知曉自己的真實身份。