根據(jù)圖畫書中的線索，柯南等人得知還有其他炸彈存在。目暮警官馬上出動(dòng)全體警力前去搜查，不料卻發(fā)現(xiàn)其余的炸彈都只是爆炸犯捉弄警方的惡作劇，而真正的炸彈早已按照計(jì)劃在指定地點(diǎn)爆炸。正當(dāng)調(diào)查一籌莫展時(shí)，目暮警官突然接到匿名電話報(bào)警，稱自己發(fā)現(xiàn)了爆炸犯的藏身之處。而正當(dāng)眾人趕往此地時(shí)，據(jù)稱是犯人居住的地方卻再一次發(fā)生了爆炸……

柯南等人幫助舊書店店主裕次郎搬運(yùn)書籍，并在書店遇到了裕次郎的兒子一郎。一郎對于父親經(jīng)營舊書店的事感到很不滿，爭執(zhí)中眾人不歡而散。在光彥的帶領(lǐng)下，柯南等人來到了舊書店旁的公園，準(zhǔn)備觀看蒸汽機(jī)車發(fā)動(dòng)的場面，并在等待的途中偶遇了一郎。正當(dāng)眾人與蒸汽機(jī)車合影完畢返回書店時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)裕次郎被壓在了倒塌的書架下面……

"圣魂村地處偏僻，山路崎嶇，村里人煙稀少，很少與外界接觸。在竹林深處的小木屋里，爐膛里的小火苗燒得正旺，盡管外面下著鵝毛大雪，可是小木屋里卻溫暖如春，少年唐三睡得正酣，他又一次夢到自己來到一個(gè)魔幻世界，地上種滿了藍(lán)銀草，遠(yuǎn)處傳來一個(gè)女人溫柔的喊聲，她喊著唐三的名字，答應(yīng)會一直等他，唐三被夢嚇醒，他覺得那溫柔的聲音是母親的。唐三冒著大雪出去劈柴，把爐膛的火加到更旺，他準(zhǔn)備好飯菜給父親唐昊送來，發(fā)現(xiàn)他又醉得不省人事，自從妻子三妹難產(chǎn)死后，唐昊就因傷心過度開始酗酒，唐三很小就看到父親這樣，他早已經(jīng)司空見慣，把父親扶到床上睡下。天剛蒙蒙亮，唐三就像平常一樣拿著那本“玄天寶錄”來到森林深處修煉絕技，這門絕技必須在清晨紫氣東來的時(shí)候修煉，唐三一心想練到玄天功第九重，可是過了第一重就遇到了瓶頸，他始終無法沖破。唐三聚精會神練功后，返程路上看到倒地的車子，聽到旁邊傳來奇怪的聲響，唐三扒開草叢，發(fā)現(xiàn)人面魔蛛只得慌忙逃跑，逃跑途中擺脫不了只能用他的暗器刺瞎人面魔蛛的眼睛。可這刺激人面魔蛛來尋仇，唐三拼命反抗，人面魔蛛對他步步緊逼，招招致命，唐三嚇得落荒而逃，魔蛛對他窮追不舍，唐三腳下一滑摔倒在地，他嚇得緊

在幫純子小姐調(diào)查入室偷竊的時(shí)候小五郎和柯南遇到了一起命案，死者是純子小姐的鄰居北上先生，初步判斷為酗酒墜樓，但在高木警官調(diào)查附近鄰居時(shí)柯南看出了端倪。所調(diào)查的房間里柯南看到了幾處線索，這些都可以說明北上并非意外墜亡，但是柯南還是沒有找到關(guān)鍵的證據(jù)，小五郎在電梯里整理儀容時(shí)柯南突然明白了什么。

柯南等人來到方斗寺調(diào)查會預(yù)知未來的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內(nèi)留宿。正當(dāng)眾人享用晚飯時(shí)，突然從房內(nèi)傳出一聲慘叫，原來是正在房中念經(jīng)的住持被人殺害。毛利小五郎通過柯南在院內(nèi)找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當(dāng)兇手跪地坦白自己的罪行時(shí)，柯南突然發(fā)現(xiàn)案件并沒有結(jié)束……