小蘭從昏迷中醒來(lái)時(shí)發(fā)現(xiàn)自己在一個(gè)小木屋里，并且身上的傷也被人包扎好了，這時(shí)，小五郎他們也找到了這里，服部在隔壁的房間發(fā)現(xiàn)了很多新線(xiàn)索，他把案件從新理順后，將所有人都叫到了村長(zhǎng)家，并指認(rèn)這個(gè)用刀刺傷河內(nèi)深里的人就是他身旁的工藤新一，沒(méi)想到被揭穿后，新一竟然嚎啕大哭并主動(dòng)承認(rèn)自己的罪行，就在這時(shí)，死羅神出現(xiàn)。

警察在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)筆記本，上面以流動(dòng)日記的形式寫(xiě)著這四名死者害死甲斐先生的秘密，根據(jù)這個(gè)筆記本，大和警官推測(cè)兇手就是因?yàn)閮?nèi)疚而動(dòng)手殺人的繁次。但是還有疑點(diǎn)并未解開(kāi)，于是，柯南和服部?jī)扇嗽俅蝸?lái)到了綾華的死亡現(xiàn)場(chǎng)，并從一名警察那里聽(tīng)到了關(guān)鍵的線(xiàn)索，兇手就是……

為搜集線(xiàn)索，警方?jīng)Q定去死者摔下來(lái)的懸崖一探究竟，然而除了雪人什么也沒(méi)有，突然刮起一陣大風(fēng)，元太為拿回被風(fēng)吹走的手套跌倒在雪地上，他說(shuō)自己聞到了一股咸咸的味道，這無(wú)疑給柯南提供了一條重要的線(xiàn)索。就在警察要以意外事件了解此案時(shí)，阿笠博士叫所有人來(lái)到堆放雪人的地方，柯南將警察山村麻醉，躲在雪人身后將兇手使用的手法一一道來(lái)。

放課后，小林老師神神秘秘的讓同學(xué)們都離開(kāi)教室，待大家午餐完畢返回教室，卻發(fā)現(xiàn)黑板上留有一張“怪人二百面相”的字條，柯南一眼就看穿了這個(gè)江戶(hù)川亂步迷老師的意圖，之后，同學(xué)們又紛紛從自己的抽屜里找到了數(shù)字和篩子的圖紙，柯南輕松看出暗號(hào)的所指，就在他要揭秘時(shí)卻被廣播叫走，解謎的重任就交給了1年B班所有同學(xué)，沒(méi)有柯南的幫助，他們能否解開(kāi)暗號(hào)找到老師呢？

在找到的眾多刀具中，并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)婆婆半夜所打磨的刀，并且阿笠博士發(fā)現(xiàn)自己帶來(lái)露營(yíng)用的錘子也不見(jiàn)了蹤跡，就在柯南思考兇手為何拿走錘子時(shí)，步美正準(zhǔn)備向魚(yú)缸里倒水，他也由此而注意到了水位的下降，斷定兇器就在魚(yú)缸中，那么兇手就一定是他！期間，柯南還發(fā)現(xiàn)了婆婆幾十年前就離家的孫子翔太，許久未見(jiàn)，孫子又會(huì)以什么樣的表情面對(duì)婆婆呢？