警方將犯案嫌疑鎖定在三個(gè)人身上，偵訊中警察發(fā)現(xiàn)他們都對(duì)唯利是圖的死者恨之入骨，之后，小林老師魂不守舍的聽(tīng)完了其中兩人的錄音但表示這都不是兇手的聲音便匆匆離開(kāi)了警局。次日，白鳥(niǎo)警官主動(dòng)來(lái)到帝丹小學(xué)向誤會(huì)他的小林老師表明心跡，不想?yún)s遭到了拒絕，當(dāng)晚，情緒低落的小林老師一人在學(xué)校值班，然而，危險(xiǎn)卻悄悄向她逼近……

大和警官和柯南等人立刻找到剩下的三個(gè)嫌疑人展開(kāi)詢(xún)問(wèn)，可是每個(gè)人都有不在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的證明，與此同時(shí)，只身一人在公館思考赤壁之謎的高明遭到了兇手的襲擊，在失去意識(shí)之前他向大和傳了一條“孔明之死”的訊息，當(dāng)柯南他們趕到公館后這里已是熊熊大火，所幸上原由衣及時(shí)將高明救出，把他送到醫(yī)院的時(shí)候，小蘭對(duì)醫(yī)生們不同顏色的衣服表示好奇，而這個(gè)問(wèn)題正好給了柯南和大和提示，讓他們破解了赤壁之謎！

這天作為地區(qū)體驗(yàn)采訪的嘉賓，小蘭和柯南來(lái)到了岡山。在參觀美術(shù)館的時(shí)候遇到失去記憶的奇怪女人，而在經(jīng)過(guò)檢查后發(fā)現(xiàn)身上還有扭打的痕跡。而趕來(lái)小五郎接受了調(diào)查她過(guò)去的委托。通過(guò)她畫(huà)的畫(huà)小蘭她們開(kāi)始尋找她的記憶，而就在這時(shí)柯南發(fā)現(xiàn)她們被跟蹤了。在來(lái)到野崎家的大宅之時(shí)出現(xiàn)了認(rèn)識(shí)她的人而她的名字是吉瀨萬(wàn)由美，找回名字的萬(wàn)由美卻突然逃走了！

小五郎帶柯南和小蘭去露天浴場(chǎng)泡溫泉的時(shí)候，聽(tīng)到了咔嚓咔嚓的石頭滑落聲，當(dāng)他們尋聲趕到后，發(fā)現(xiàn)不動(dòng)產(chǎn)社長(zhǎng)梅津英章已經(jīng)沒(méi)了呼吸，這起看似意外的事件其實(shí)是樁蓄意殺人案，警察對(duì)在場(chǎng)的嫌疑人即死者的女兒麻麗、泰子、秘書(shū)八木橋以及浴場(chǎng)老板進(jìn)行偵訊，期間，一條擰干的毛巾從麻麗的包包中掉了出來(lái)，小五郎認(rèn)為這是她為了不留指紋而使用手法，就在他準(zhǔn)備揭穿所謂的兇手時(shí)，知道真相的柯南將他麻醉揪出了真正的兇手！

在警方對(duì)三名嫌疑人進(jìn)行偵訊時(shí)，他們?nèi)朔炊嗷ブ肛?zé)并揭露對(duì)方的犯案動(dòng)機(jī)，這時(shí)，有人在更衣室內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)空瓶子，另外在湖面上還有漂浮的火柴棒，為了弄清真相，警方又找來(lái)工作人員進(jìn)行對(duì)峙，然而，他們卻表示并未發(fā)現(xiàn)異樣，期間，女主演深汐的一句話點(diǎn)醒了柯南，在他的引導(dǎo)下，大家得知一整夜都呆在溫泉里的人并不是兇手而是死者本人，那么，兇手到底是誰(shuí)？在他的身上又有怎樣的關(guān)鍵性證據(jù)？