紀曉嵐夜讀時又接到被扔進窗子的紙條，上面寫有郭天的消息，紀曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀曉嵐夜探郭天，得到通報的和珅與盧焯眼見沒有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過盧安，再見機救出瑤琴。紀曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調查國庫虧空一案。紀曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫，以自己掌握的情況博得宋司庫信任，并抓住其惶恐的心理，以消災為由取得真賬本。和珅模不透紀曉嵐葫蘆里賣的是什么藥，便決定先下手為強，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認罪，卻沒料到乾隆在盧安即將動身時救出瑤琴。

乾隆、和珅以及紀曉嵐將真相告訴太后，太后賜如玉無罪。得知皇上要召自己入宮，如玉婉拒。朱公公在和珅的指使下告訴戴沾，其在獄中所寫文章均被馮姓編纂官據為已有。戴沾氣憤不已，與馮扭打在一起，失手將馮打昏。戴沾外出求救時，朱公公將馮打死，陷害是戴沾所為。和珅轉而找到如玉，答應其入宮之后即免戴沾死罪。如玉為救戴沾，答應入宮。紀曉嵐設計詐朱公公說真相，戴沾被釋放。得知如玉為救自己而嫁入宮中，戴沾不顧一切聞人宮中。太后得知真相后赦戴沾無罪。皇上也成人之美，賜戴沾、如玉成婚。內務府齊蘇圖家出殯。民工古大力因為被齊家拖欠工錢而耿耿于懷，帶領眾民工在半路突襲出殯隊伍。棺材落地，撤出一地的金銀珠寶，其中還有印有內務府字樣的國庫元寶，惟獨不見尸體。齊蘇圖伯自己私吞國庫銀兩的罪行敗露，便殺死老仆齊平假裝出葬之人。受賄于齊家的和珅在朝上將罪責推到對手順天府尹身上，責其治安不利，使死者暴尸街頭。順天府尹因為懾于和珅的yin威而承認自己失職。

福康安與和因偷偷挪用貢珠煉取仙丹而惴惴不安，備受太后寵愛的小月跟隨紀曉嵐奉旨赴臨青州，調查藥方疑案，和見阻撓不成，詐稱可助他們一臂之力，騙取皇上信任。幾個人輾轉住進一如意樓。側面打聽到此地有一位名叫黃鐵牙的神醫。 四姑娘尾隨而至，直闖紀曉嵐房間，語帶雙關二人詩詞酬和，心照不宣。小月多疑，頓生不滿。實際上四姑娘此行特為要對御醫呂長安殺人滅口。十四王爺又密授兩位黑衣女子跟蹤四姑娘必要時斬草除根。 名醫世家出身的炳康和香草是青梅竹馬的伙伴，二人勤勤懇懇，為煉就一付能長生不第之仙藥不辭勞苦，炳唐之父，正是才因奶娘暴亡而受牽連的御醫呂長安--神醫黃鐵牙，此番在家鄉被香草之父，德和堂藥鋪何掌柜收留，隱姓埋名。 尷尬人偏遇尷尬事，小月剛剛與逡巡而來，闖入如意樓的和撞個滿懷，又與來無影去無蹤的四姑娘“巧遇”。

和珅擔心張了了會牽連自己，便想用乾隆之手殺其滅口。紀曉嵐說出張了了是受人指使的真相，乾隆堅持給張了了定罪，關鍵時刻，小月趕到并拿出乾隆的扳指替張了了求情，乾隆成人之美，讓其與柳哥相聚。父女得以團聚。乾隆責怪和珅、紀曉嵐此行辦事不力，押送兩人坐囚車回京，以示懲罰。途中，二人依然針鋒相對，樂此不疲。瑤琴意識到乾隆身為一國之君，并不能給予自己想要的平靜生活，于是拒絕與乾隆一同回京，表示要與父親歸隱山野，乾隆無限失落。回京后，乾隆罰和珅、紀曉嵐掃地，兩人邊掃邊唇槍舌劍。乾隆暗得意，自知只有正邪共存，兩者相斗，自己才能享受安寧。"

和危言聳聽，恐嚇與利誘兼施，幸紀曉嵐及時趕到，將小月帶離和府。 皇上怪罪紀曉嵐尋人不利，要將他押往午門問斬，一直躲在閱微書房的莫愁被迫現身出面，紀曉嵐趁機要求金鸞殿上的皇上給莫愁名份，從此可以清清白白做人。但滿漢通婚，大清法律本不應允，要通過太后首肯，豈是易事！何況又有和等煽動一些大臣，尋隙報復，百般刁難。太后以祖宗之法罰，皇上表跪思過，患得患失之后，皇上決定讓步。 豐紳殷德一身武裝，將赴邊疆征戰。臨行之前，與軍豪剖白心跡。兩人相約，半年之內，均不談婚論嫁，建功立業后，再贏得小月芳心。 三姑自作多情，一心想與孑然一身的紀曉嵐成雙作對，害得一向無所畏懼的紀大人是心驚肉跳，避之不及。不出半年，豐紳殷德凱旋歸來，小月欣然坡門相迎，不想他已雙目失明。