為了紀念戰國武將信長入主岐阜城450周年，偵探少年團和阿笠博士來到岐阜市內游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當地的英雄秀表演。表演結束后，光彥因想得到簽名而獨自返回觀看場所，然而他卻在尋找表演人員的過程中遭到綁架……與此同時，在博物館展出的信長公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。

半年前毛利小五郎去杯戶北町工作時，碰巧遇到了一起事件。名為桐崎禮美的女性被發現吊死在自己的公寓中，因為房東和桐崎的鄰居惠小姐都能證明她有自殺的傾向，外加她還留有一封遺書，所以事件被當做自殺處理。桐崎的死讓惠小姐非常自責，而小五郎的話讓她重新振作了起來，為了感謝小五郎才有了今天的約會，但在約會中柯南卻看出那起案件的隱情。

利用步美找到的暗號解讀表，柯南本以為能順利解開暗號，不料卻遇到了瓶頸。正當此時，若狹老師再次拜托少年偵探團前往舊倉庫尋找石灰。來到舊倉庫的眾人發現倉庫一片狼藉，在若狹老師不經意的提示下，柯南終于解開了暗號的含義，并推測犯人將再次來到舊倉庫。為了避免打草驚蛇，柯南設計誤導犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來到舊倉庫，柯南能否順利將犯人一網打盡？

終于熬到了周一，足球隊員問米小圈怎么沒有去打球，米小圈也很無奈，米爸讓他好好練習畫畫，今后好成為聞名世界的大畫家，隊員樂不可支，稱終于將力量相當的米小圈逐出隊伍，今后便可以自己成肌肉老師心目中的第一名了。聽到隊員這句話，無異于給米小圈一個殺手锏，他憤憤不平但是毫無辦法。接著，米小圈又收到一封來自未來的信箋，上面讓他噴水再看，結果米小圈照做，果真看到上面的字了，上面寫著米小圈將來是個大畫家，并且享譽全世界，讓米小圈抓緊現在的每一分鐘好好學習。信箋背后的署名是未來的米小圈。米小圈才不會那么傻，他拿著信箋跑去找米博文，稱自己知道他的伎倆，知道那封字跡會消失的信箋是他寫的，并且叮囑米博文今后還是不要費力氣了，他還是喜歡踢足球，根本不想成為畫家。米博文愣愣站在那里，臉上帶著一副無辜的表情。米小圈將那封來自未來自己的心給車遲說了，車遲卻覺得這是一個非常好的創意，剛好為他未來的發明指明方向，看到車遲什么都能聯想到未來，米小圈很是無奈。沒過多久，米小圈又接到一封匿名信，對方又稱是未來的米小圈寫的，并且稱米小圈未來真的就是一個畫家，并且為了證明他說的沒粗，還給了米小圈另外三個預言，就是米小圈會吃到一餐大

日賣體育記者加賀爪弘和橋爪明曾在一年前報道過一篇關于大企業老板角山制作所的山角雄三社長去世引發的遺囑失蹤事件，這兩位記者當時不斷煽風點火，將自己挖到的爭奪遺產的丑聞都刊登在雜志上害的親屬爭執不斷最后甚至引發了殺人未遂案。柯南白天在餐館遇到了這兩名關系很差的記者，沒想到就在當晚，加賀爪弘竟然被發現在河邊遇害。