當(dāng)晚，這名潛入醫(yī)院的黑暗組織同伙南田陸道果然展開了行動，但同時(shí)FBI也暴露了行動，南田陸道在驅(qū)車逃跑的過程中舉槍自盡，雖然柯南破壞了他的手機(jī)但他還是通過其他手段將搜集來的信息傳給了組織。既然事情發(fā)展到這種地步，轉(zhuǎn)院無疑就是在向黑暗組織昭示水無憐奈就在這里，所以只能另想對策。另一方面，英祐伺機(jī)潛入了水無憐奈的病房，并發(fā)現(xiàn)她早已從昏迷中蘇醒。

一名老護(hù)士告訴柯南，她以前見過英祐并且在他小的時(shí)候還因白血病做過手術(shù)。另一方面，得知杯戶中央醫(yī)院被黑暗組織入侵后，柯南和FBI立刻對醫(yī)院的病人進(jìn)行了排查，其中最具嫌疑的有三個(gè)人，為找出那個(gè)在醫(yī)院調(diào)查水無憐奈的人，柯南想出了一條妙計(jì)，他直接與這三個(gè)嫌疑者接觸，最終將目標(biāo)鎖定，在接下來的行動中，柯南和FBI又能得到什么樣的線索？

小蘭興致勃勃的來到妃英理的律師事務(wù)所，試圖幫父母慶祝他們第一次約會紀(jì)念日，可妃英理卻在接了一通電話后匆匆離去，之后小蘭在一個(gè)大花瓶里發(fā)現(xiàn)了自己媽媽和陌生男人在一起的合照以及結(jié)婚戒指，氣憤的小蘭一路跟蹤到了一家咖啡館，卻看見妃英理正在和照片上的男人一起喝咖啡，就在小蘭想要揮舞拳頭沖向這個(gè)“外遇男”時(shí)，柯南的一句話打消了她的念頭。

電視臺要制作與小五郎24小時(shí)密切接觸的電視節(jié)目，為了討論節(jié)目內(nèi)容，小五郎帶著柯南和小蘭隨節(jié)目制作公司的社長染井彰吾一起前往東都電視臺制作人中目賴策的家中商討方案，沒想到大門竟然上了鎖而且按門鈴也沒有回應(yīng)，于是請來管理員打開門進(jìn)入公寓，出現(xiàn)在他們眼前的是因喝下毒咖啡而身亡的中目的尸體，從在桌面和地面上打翻的咖啡痕跡，柯南看出這是一起密室殺人案。

工藤收到屋田誠人的信，信上說他一年前辦的案子有差錯(cuò)讓他重新調(diào)查，于是，在服部、小五郎等人的陪伴下他們一起前往那個(gè)村莊。柯南只身來到了信上所說的地址，不想被關(guān)進(jìn)了小木屋，就在這時(shí)，他因?yàn)檎`食解藥的身體開始發(fā)生變化，逃脫期間掉進(jìn)了旁邊的湖里，被人發(fā)現(xiàn)時(shí)他已經(jīng)失去記憶。為了讓他想起過去，服部一行帶著新一來到了當(dāng)時(shí)的案發(fā)現(xiàn)場日源村長家，并在這里碰見了記者河內(nèi)深里以及屋田誠人的同學(xué)水川萌生。