照經(jīng)營(yíng)管理出租公寓的桐谷貴江婆婆的說(shuō)法，小五郎每個(gè)禮拜都會(huì)到她家里幫忙解決難題，對(duì)此感到難以置信的小蘭和柯南一起來(lái)到了桐谷婆婆家里等待，而出現(xiàn)的卻是自稱婆婆孫女男友的恩田，而他特地打扮成小五郎的目的只是為了探望婆婆的情況。婆婆管理的出租公寓內(nèi)傳來(lái)了慘叫，作為房客的傅川先生被害，而真正的兇手就在發(fā)現(xiàn)尸體的三個(gè)房客之中。

與這起密室殺人事件有關(guān)的三人都被問(wèn)話，柯南對(duì)這起在自己身旁發(fā)生的殺人事件已經(jīng)有了眉目，但在波本面前他沒(méi)有辦法利用麻醉槍。無(wú)法讓小五郎沉睡的柯南只能將大家向案件的真相誘導(dǎo)，而在這場(chǎng)推理中解密的正是波本，案件雖然順利解決，但案件的背后又是一個(gè)悲傷的故事。

繼輕井澤別墅中的若松先生遇害之后，他的兒子玉郎也在東京的家中被毒殺，不可思議的是除了玉郎吃掉的那塊蛋糕意外并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)其他的蛋糕上有毒。于此同時(shí)，大和敢助警官等人注意到了被殺害的若松先生浴室的瓷磚是運(yùn)用了一種名為陰影鉆石錯(cuò)視的會(huì)引發(fā)視覺(jué)錯(cuò)覺(jué)的形狀，總算讓若松社長(zhǎng)的死亡訊息再次顯現(xiàn)出來(lái)，而現(xiàn)實(shí)出的字母竟是SON。

小五郎一大早便被少年偵探團(tuán)纏上，他們委托小五郎調(diào)查的案件是米花町活動(dòng)中心的花圃破壞事件，而在調(diào)查過(guò)程中與山崎小姐發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)的花店老板奧田態(tài)度非常惡劣，因?yàn)樾D小姐的緣故小五郎決定介入調(diào)查。當(dāng)眾人晚上再次來(lái)到活動(dòng)中心時(shí)花圃已經(jīng)遭到了破壞，在破壞的花圃旁還看見(jiàn)了山崎小姐的尸體，奧田被當(dāng)場(chǎng)抓住，但事件的真相到底是什么呢？

在死去的西澤家里發(fā)現(xiàn)了作案的手法和遺書(shū)，看似自殺的現(xiàn)場(chǎng)還存在很多疑點(diǎn)，在現(xiàn)金還沒(méi)有歸還的情況下小五郎檢查繼續(xù)調(diào)查。西澤的好友田中和公司社長(zhǎng)的互相指正引起了小五郎的懷疑，而一路探查的柯南看到了漂浮在宇田川河面上的部分鈔票，經(jīng)過(guò)整理之后柯南得知了這次事件的兇手，而他將代替感冒的小五郎為大家揭曉真相。