紀曉嵐不肯循親枉法，力數薛大老板之罪狀，皇上無言以對，和巧言令色，深通馬屁術和離間術，莫愁聞知老夫人既是貪案的罪魁禍首，想到為此犧牲的黃克明，舉劍直指老夫人，并慷慨陳詞，欲報仇血恨，皇上深為震驚，迫于情勢，決定親自出馬，弄清案情，查明真相。 紀曉嵐與和天生一對冤家對頭，一旦相見，便免不了冷嘲熱諷。和建議以無關緊要的人物做替罪羊洗清柳志夫人的污點，紀曉嵐豈相從，柳志夫人痛訴多年來失子之痛，才為彌補失落感，用金錢報仇世人。皇上矛盾不已，紀曉嵐毫不手軟，斷然判案，不惜身家性命。柳志夫人自知罪孽重，不忍再為難皇上毅然服毒自盡。 一日，紫禁城內，君臣又聚在一起，為奶娘命案一事產生歧義，和深知此案頗多詭異，不愿輕易牽掛上身，紀曉崗卻明察秋毫，知此中大有文章，正欲深入調查，御醫呂長安卻越獄逃跑。

京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

"紀曉嵐邀請縣宮張萬節著便裝與自己外出吃飯。席間，不明真相的飯館老板在紀曉嵐的詢問下痛斥張萬節花錢買官、魚肉百姓。張萬節羞怒交加卻不好發作。送走紀曉嵐后張萬節下令逮捕飯館老板以報當日蒙羞之仇。紀曉嵐和小月返回飯館，告知老板真相，老板深感大禍臨頭。紀曉嵐讓其配合自己施計并保證其毫發無傷。面對前來抓捕老板的衙役，扮作乞丐的紀曉嵐大罵張萬節，被一同押走。張萬節正欲對二人用私刑，小月趕到，張萬節這才意識到自己中了計。紀曉嵐建議乾隆在江南開恩科選舉人才。小月跑到房梁上生悶氣，紀曉嵐只得也上房相勸，不想失足摔落。和珅前來探望，幸災樂禍地表示皇上準派自己為主考官，紀曉嵐后悔不迭。乾隆駕到，宣布小月為監督巡閱，以杜絕考場徊私舞弊。得到和珅指示的趙文龍賄賂考官左山傀安排考場作弊之事。左山傀想到自己清白一生卻毫無升遷機會深感不平，最終沒能經受住誘惑。

紀曉嵐頗為欣賞如玉的才情，于是讓如玉女巧扮男裝，跟隨自己去大內看《四庫全書》的編纂。和珅將紀曉嵐寫下的奏章呈給乾隆，乾隆大悅，讓紀曉嵐在宮中騎馬作為獎勵。和珅散布謠言說紀曉嵐當初扣下顏驥的藏書只為查反書以取說皇上，眾官皆信不已，紀曉嵐有口難辯。顏驥的學生戴沾一直潛心幫紀曉嵐著書，得知此消息，痛斥紀曉嵐道貌岸然，被官府以辱罵朝廷命官為由投進大獄。紀曉嵐見到奏章實為自己筆跡，百思不得其解。小月深夜潛入和府要盜出迷魂煙草，不料中了和珅的圈套，將假煙草拿回了紀府。紀曉嵐檢驗煙草的真偽，不料牙齒被煙草染黑。早朝時，和珅看到紀曉嵐閉口不語很是幸災樂禍，并千方百計的讓紀曉嵐在乾隆面前開口。紀曉嵐將計就計，引經據典，表示“黑齒”之舉只是為了提醒皇上理政之道。乾隆深感紀曉嵐的一番苦心，高興之余獎紀紀曉嵐煙草，紀曉嵐表示愿意用煙草換戴沾免罪。戴沾同意前往紀曉嵐家中繼續編纂《四庫全書》。和珅找到神父，表示要捐資修教堂，神父經受不住誘惑，將紀曉嵐佯裝找到迷魂煙草的真相全盤托了出。如玉與戴沾同在紀曉嵐家中。見到戴沾的正直之舉，如玉很是欽佩。

和珅將顏家平反的功勞全攬到自己身上，將紀曉嵐說的一無是處。如玉受到蒙騙，懇請和珅幫自己報仇。和珅將偽造的金煙桿交給如玉，讓其盜出真煙桿以陷害紀曉嵐。如玉讓戴沾里應外合，戴沾只得勉強答應。戴沾見如玉成功，為表示自己因為此舉而深感愧疚，要放棄修書。乾隆與和珅夜訪紀府，紀曉嵐在和珅的慫恿下拿出金煙桿，卻發現煙桿為偽造之物，紀曉嵐愕然。劉全建議和珅殺如玉滅口，以掩蓋煙桿之謎。和珅突然升起憐香惜玉之情。紀曉嵐為煙桿之事一籌莫展，隱隱感覺此事與和珅有關。從紀曉嵐口中得知戴沾已替自己攬下全部罪責，如玉頓時亂了方寸。戴沾表示自己并沒有認罪，如玉方才察覺自己已中了紀曉嵐的圈套。兩人爭相要替對方承擔罪責。如玉決定自首。一個殺手受劉全指使，謊稱替紀曉嵐來接如玉。如玉被帶至一荒廟。就在殺手要下手時，小月趕到，救出如玉，并告訴其和珅的真實面目，鼓勵如玉狀告和珅。