紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

乾隆邀如玉共眠，如玉只得說出自己的真實身份。和珅以小月要挾紀曉嵐交出八哥，紀曉嵐無奈答應。太后親臨四庫館，見到才貌俱備的如玉甚是喜歡。太后召小月進宮，紀曉嵐囑咐小月告訴太后和珅家有一只會說人話的八哥。太后欲將小月許配給如玉。太后和乾隆興沖沖地要看和珅的八哥，和珅得意之余卻發現往日甜言蜜語的八哥此時只會痛罵太后。紀曉嵐表示自己還有一只會說賀詞的八哥，但要用金煙桿來換。和珅無奈應允。和珅以獻鳥博得太后歡心，本以為乾隆會指派自己擔任總纂官，誰知皇上以紀曉嵐找回煙桿為由讓其官復原職。乾隆經過和如玉的接觸，已對其產生愛慕之情，他命和珅阻攔如玉和小月的婚事。與此同時，紀曉嵐對如玉表示只有同意與小月的婚事，才能救出戴沾。

蘇姑娘看穿和為人，要小月轉告紀大人，少與之沖突，以免吃虧，卿憐且修無字書一封，令紀曉嵐更是憐其有，如何救他出樊籠呢？小月自告奮勇，冒險以和孝公主的龍派放走了卿憐。 為防貪官滋生不已，皇上集思廣益，和信口雌黃，滿嘴歪理，紀曉嵐抓住漏洞，窮追不舍，看到兩個心腹的臣子背道而弛，互相作對，皇上倒不失坦率，自承為君之道：左右逢源，坐收漁利。 卿憐失蹤，皇上激怒，遷罪于紀曉嵐，罰他作崇文門守軍，看到老對頭倒霉，和簡直是心花怒放，得決忘形。莫愁因屢建奇功，加之性情乖巧，善解人意，頗受皇上器重，她的求情皇上自然聽得進去，何況皇上愛才，亦不忍不愿失去博學廣記，足智多謀的大學士，只是借故懲罰這個膽敢冒犯自己的人。皇上借“對詩”作理由，令和尋訪蘇姑娘。和無奈，只得厚著臉皮向紀曉嵐討教。為此小事一樁，和動員各地黨羽興師動眾，其結黨營私的做派令紀曉嵐十分厭惡，于上卻勸他“難得糊涂”。

十四王爺心生惻隱之心，情急之中沖上前來與皇上閑談敘舊。皇上以半片金鎖設問王爺家事，引得冷眼旁觀的四姑娘憤憤不已。原來她與皇上有殺父之仇。皇上與王爺推杯換盞之際，忽然遭遇一群刺客。授命保駕的福康安率伏兵與之展開混戰。雖是兩主對陳，四姑娘的出手不凡還是深深地打動了福康安的心。 紀曉嵐以大內祭天的樂曲期望引起皇上的注意，莫愁警，迅速將之隔離，并趁機再次俘虜和。二人困在孤島之上，不免談天說地，無論是為官之術還是為人之道，紀曉嵐與和的見解都格格不入，雖然滔滔不絕，卻話不投機。用盡了心思，打碎了算盤，和棄紀曉嵐于不顧，兀自浮水沈生而去，驚魂未定，便與福康安密謀，一心要將調查云州貪污案的紀曉嵐置于死地，深恐他一旦自由，必定會對亦涉及此案的自己不利。 紀曉嵐被莫愁挾持到戲班，在后臺，他一邊憑借著驚人的記憶力默寫帳冊，一邊替不通文墨的小月書寫要上演的劇目招，那瀟灑自如的筆墨字跡張貼在人來人往熙熙攘攘的戲園門前，立刻引起了途經此地的皇上注意。

乾隆拜祭顏驥，碰到女扮男裝的如玉。乾隆對如玉的見解產生興趣。這時殺手趕到，乾隆挺身相救，并帶如玉從樓上一躍而下逃脫了追殺。紀曉嵐想到往年和珅都請自己給太后寫祝壽賦，于是想借此來向和珅交換煙桿。誰知和珅拿出戴沾的祝壽賦來賣弄，紀曉嵐仔細看過后指出賦中暗藏對太后不敬之辭，和珅氣急敗壞。御醫為如玉療傷，卻發現如玉實為女兒身。得知紀曉嵐將賦中暗語告訴和珅，戴沾痛斥紀曉嵐。紀曉嵐苦口婆心規勸戴沾不要因一時沖動而葬送終生，兩人盡釋前嫌。乾隆下旨除去紀曉嵐《四庫全書》總纂官的職務，和珅幸災樂禍。如玉醒來得知乾隆身份大驚。乾隆佯裝不知如玉為女兒身，邀其共眠，如玉百般推辭。乾隆裝睡，如玉想到乾隆賜死全家，欲殺乾隆報仇，但想到自己為乾隆所救又不忍下手，痛苦之時想一死了之，被乾隆攔下。乾隆心下斷定如玉與顏驥有關。和珅指使同為編纂官的馮大人到獄中探望戴沾，馮慌稱要把戴沾的手稿編纂成冊，卻暗中將手稿交給了和珅，以換取自己落在和珅手中的罪證。乾隆帶如玉前往四庫館。如玉盡顯才學，被乾隆指派到四庫館修書。