在砂田善三叔叔的邀請下園子、小蘭和柯南一起來到溫室觀看開花的金琥，在參觀的過程中愛發(fā)脾氣的善三叔叔和自己的兩個兒子因?yàn)檫z囑的事情起了爭執(zhí)。吃過八代小姐做的晚飯后柯南等人聽見了溫室的警報聲，趕過去的他們看到的是握著遺囑驚慌失措的康之，而砂田善三已經(jīng)死在了溫室里。

八號車廂里的殺人事件已經(jīng)偵破，而有希子與苦艾酒的對峙還沒有結(jié)束，在八號車廂制造火災(zāi)假象后等待著小哀的是波本。與苦艾酒所計劃的一樣，隨著列車的爆炸苦艾酒的任務(wù)也告一段落，正在品味勝利成果的她卻又看到了和少年偵探團(tuán)一起的小哀，這一切的背后還有所隱藏，前來協(xié)助柯南的究竟是何方神圣？

事故現(xiàn)場的三人里面可能就有近期惡性循環(huán)破壞車輛案的兇手，為了幫助遲鈍的千葉警官步美等人用盡了辦法，但不解風(fēng)情的由美警官卻時常打斷兩人的獨(dú)處，在得知了真相之后由美仿佛看到了唯一單身的自己慘淡的生活，她對兩人的妨礙更加變本加厲。在被破壞的車子中柯南看到了他們的共同點(diǎn)，這是兇手想要強(qiáng)迫閉上雙眼的駕駛員睜大眼睛的報復(fù)行為。

通過大和警官對若松社長死訊的調(diào)查，已經(jīng)被毒殺的玉郎便是殺害自己父親若松的兇手，這使案件更加撲朔迷離，柯南和服部一方面拜托高木警官改變方向調(diào)查仰慕若松社長的人，一方面開始調(diào)查玉郎中毒的原因。找到玉郎中毒原因的柯南和服部把目標(biāo)鎖定在大家的拖鞋上，唯一沒被檢查的社長夫人卻死在了自己的房間里。

柯南一行人在阿笠博士的陪同下一起去山上露營，在柯南和博士前去買東西時碰巧遇到了世良真純。另一方面，在山上撿拾柴火的灰原等人碰到了正在掩埋尸體的可疑人物，無法與柯南聯(lián)系的他們只能逃到了山中的小木屋內(nèi)，但讓他們沒想到的是這里便是兇案的事發(fā)現(xiàn)場，在柯南等人開始調(diào)查三個有嫌疑的人時小木屋卻燒起來了。