小蘭去找新娘香取茜草時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)休息室內(nèi)空無(wú)一人，于是柯南和小蘭等人分頭行動(dòng)。根據(jù)那張繡球花的照片，柯南在噴泉的雕像上找到了丟失的紅寶石戒指，可是茜草依舊不見(jiàn)蹤影，小蘭和園子在風(fēng)車(chē)木屋附近找到了茜草的一只高跟鞋，便斷定她一定是被人綁架了，這時(shí)，時(shí)鐘響起柯南聽(tīng)出了其中的怪異，便循著聲音找到了茜草，可茜草卻說(shuō)真正有危險(xiǎn)的是阿妙婆婆……

參加網(wǎng)球比賽的柯南他們來(lái)到熊本縣。市內(nèi)觀光的途中，園子撿到一部手機(jī)。手機(jī)的畫(huà)面上是“想要遇見(jiàn)那個(gè)孩子”的短信。園子與小蘭得到與園子同名女子的戀人的幫助，帶著手機(jī)出現(xiàn)在咖啡店。小蘭無(wú)意中聽(tīng)到兩人的危險(xiǎn)談話被綁架，而在小蘭打來(lái)的電話中柯南他們開(kāi)始進(jìn)行調(diào)查決心已定要組織這場(chǎng)謀殺！

發(fā)燒的小哀醒過(guò)來(lái)發(fā)現(xiàn)阿笠博士倒在了電腦之前，正當(dāng)小哀以為教授被黑衣人殺害的時(shí)候發(fā)現(xiàn)只是誤會(huì)。之后柯南，小哀和阿笠博士去拜訪了哀的父親宮野博士的朋友出島。他們認(rèn)為他可能多少知道一點(diǎn)黑暗組織的以及哀父親的行蹤，但是出島也已經(jīng)30多年沒(méi)和宮野博士碰頭了。但是就是最近宮野博士女兒明美曾來(lái)拜訪過(guò)，正當(dāng)柯南，小哀尋找明美留在這里的物品時(shí)出島卻意外死亡！

小五郎受委托調(diào)查游戲軟件工程師板倉(cāng)死亡。目暮警官斷定是心臟病發(fā)作的殺人事件。小五郎懷疑三名委托人是嫌疑犯，但沒(méi)有證據(jù)?？履蠟榱说玫接涗浿谏M織線索的被害者日記磁片，急于解決事件。但一直沒(méi)有機(jī)會(huì)。而在案件調(diào)查方面最終在看到不自然的圍棋盤(pán)之后柯南得知死者留下的死前訊息并指出了兇手的所在。

柯南他們與正在公園找尋東西的高木刑事相遇。原來(lái)他在這里調(diào)解吵架后，不小心把遺失了警察手冊(cè)。高木刑事調(diào)解的當(dāng)事人之一是無(wú)名的歌手半崎，好象就住在公園附近?？履纤麄兎诸^找尋半崎，卻不見(jiàn)他人影。正要放棄時(shí)半崎在公園里出現(xiàn)?？履媳娙税l(fā)現(xiàn)半崎的疑點(diǎn)，在偵查推理之后眾人救下了顯遭殺害的杉山。高木也找回了自己的警察手冊(cè)。