此次幽靈恐慌的第二天，柯南他們下榻的民宅的主人—永倉(cāng)先生被人襲擊了。永倉(cāng)先生雖然沒(méi)有生命危險(xiǎn)，但是犯人是誰(shuí)卻不得而知。警察以重要參照人為理由帶走了從在進(jìn)行地球遺產(chǎn)登陸委員會(huì)那里派來(lái)的缺德調(diào)查官川治，但柯南卻發(fā)覺(jué)這其中不自然的地方，最終少年偵探團(tuán)的各位找到了真正的犯人并將找出了幽靈少女的真相。

在園子的邀請(qǐng)下，小蘭和少年偵探隊(duì)來(lái)到奧谷湖舉辦的釣魚(yú)大賽，還在這里認(rèn)識(shí)了有奪冠資格的鲇川沙織、鱒渕拓也以及擔(dān)任自由作家的船木敏彥一行人，在第一天比賽結(jié)束后的夜晚，鱒渕和船木似乎為了什么事情在澡堂發(fā)生了爭(zhēng)吵，沒(méi)想到第二天上午，就在園子等人釣魚(yú)的附近，發(fā)現(xiàn)了船木的尸體，警方立刻介入調(diào)查，水井說(shuō)半年前也曾有人死在那里，柯南認(rèn)為這絕不是巧合，而兇手恐怕就是鲇川和鱒渕其中之一。

參加網(wǎng)球比賽的柯南他們來(lái)到熊本縣。市內(nèi)觀光的途中，園子撿到一部手機(jī)。手機(jī)的畫(huà)面上是“想要遇見(jiàn)那個(gè)孩子”的短信。園子與小蘭得到與園子同名女子的戀人的幫助，帶著手機(jī)出現(xiàn)在咖啡店。小蘭無(wú)意中聽(tīng)到兩人的危險(xiǎn)談話被綁架，而在小蘭打來(lái)的電話中柯南他們開(kāi)始進(jìn)行調(diào)查決心已定要組織這場(chǎng)謀殺！

步美有個(gè)朋友答應(yīng)送給她豪華的七段裝飾人偶，因此步美約柯南等人來(lái)到此人家中。正巧同幢公寓里住的津曲水貴與古董鑒定師三重芳春也來(lái)到這戶人家，希望主人能轉(zhuǎn)讓一幅價(jià)值數(shù)千萬(wàn)的壁畫(huà)。女主人觀野節(jié)子和繼母彌生拒絕了2人的請(qǐng)求，但就在主人外出后，那幅壁畫(huà)失竊了。在警方的調(diào)查下少年偵探團(tuán)的各位發(fā)現(xiàn)了現(xiàn)場(chǎng)的些許的不自然的地方!

小蘭去找新娘香取茜草時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)休息室內(nèi)空無(wú)一人，于是柯南和小蘭等人分頭行動(dòng)。根據(jù)那張繡球花的照片，柯南在噴泉的雕像上找到了丟失的紅寶石戒指，可是茜草依舊不見(jiàn)蹤影，小蘭和園子在風(fēng)車(chē)木屋附近找到了茜草的一只高跟鞋，便斷定她一定是被人綁架了，這時(shí)，時(shí)鐘響起柯南聽(tīng)出了其中的怪異，便循著聲音找到了茜草，可茜草卻說(shuō)真正有危險(xiǎn)的是阿妙婆婆……