白夜團利用民眾游行包圍了雷門公司，但他們真正的目的則是片助的科學忍具研究所。當大家的注意力全被雷門公司吸引時白夜團搶走了研究所的忍術資料，鹿臺意識到這一點后立即與博人等人趕了過去，他們依靠片助的跟蹤器找到了白夜團，在同伴們的掩護下鹿臺和博人追了上去，他們能阻止白夜團的陰謀嗎？

佐助這次帶回來的信息并不樂觀，去過輝夜之城的他遇到了兩個強大的對手，大筒木金式與大筒木桃式，擺脫兩人的攻擊后佐助立刻趕了回來。博人準備去找父親理論的時候在門口撞見了佐助，想要打敗父親的博人打算拜佐助為師，但佐助開出的條件卻是讓他先學會螺旋丸。

孫堅死后，其子孫策（濮存昕飾）謀求大業，身居袁術帳下。孫策勝仗連連，居功至偉，但袁術生怕功高蓋主，對孫策異常冷落。孫策與遺臣程普、黃蓋商議后，決定用傳國玉璽跟袁術換得兵馬，進兵江東，力圖大業。在進兵途中，孫策遇到了結拜兄弟周瑜（洪宇宙飾），兩人決定合兵一處。孫策與周瑜商議先收攬江東才俊，然后攻陷劉繇。一翻大戰之后，孫策人才盡覽，立足江東，袁術悔之晚矣。

在鳴人的努力下忍者學校的修學旅行將要去水之國進行，很早前被稱為“血霧之里”的霧隱村讓很多知情的人心懷不安，但毫不知情的孩子們絲毫沒有緊張感。博人在佐良娜的推薦下當選了修學旅行委員，因為惡作劇而被綁起來的他絲毫沒有反駁的余地。經過漫長的水路他們終于來到了霧隱村，誰都不清楚在這欣欣向榮的外表下會不會還隱藏著不為人知的一面。

尸澄真等人拿到忍刀后準備組建新的忍刀七人眾引發革命，長十郎得知后準備肅清他們，如果有必要的話神樂也難逃一劫。博人說服長十郎準備私下解決這次的叛亂，他打算把事態控制到小鬼打群架的程度，沒有更好辦法的長十郎決定陪博人和佐良娜一起行動，而其他同伴也偷偷跟了上去，但持有忍刀的尸澄真一行并沒有那么好對付。