小五郎受到一個名叫立李三可的委托，帶著柯南和小蘭一起來到群馬縣調(diào)查真相，途中他們遇見了德備六朗和荒巖，并從他們口中得知了11年前有一個名叫辰彥的孩子在旅館附近的河中溺斃而亡的事件，這與信中所提及的殺人案有何聯(lián)系？辰彥父親同時也是約見地點光羅旅館的老板沼山伴藏也讓人覺得很怪異，次日清晨，滿身都是刺鼻氣味液體的伴藏死在了旅館的頂樓房間，難道是小蘭昨晚在河邊看到的河童下的毒手嗎？

這天小五郎帶著柯南和小南外吃吃飯，回家的途中遇到故意向須坂和中北的汽車，柯南用自己的充氣足球阻止了再次撞向兩人的汽車。作為答謝片寄邀請小五郎一行來到家里，而小五郎他們在門口碰到了發(fā)生口角的野笛和荻人?？履虾椭斜币黄鹪谠鹤永锿嫠r發(fā)現(xiàn)倒地身亡的片寄爺爺！而在調(diào)查過程中須坂拿出了老爺讓保管的鑰匙，而盒子里留下的卻是一封暗號信。

就在光彥撥通報警電話之時，檢查的工人以小哀作為威脅，沒有辦法下光彥掛斷了求救電話。犯人們商議著要放棄贖金處理掉一切，少年偵探團的各位陷入了危機，就在這時步美注意到柯南發(fā)出的信號，按照指示給依次給步美，柯南，元太和阿笠博士的手機打電話來分散犯人的注意力，但因為聲音太大反而引發(fā)了犯人的注意。而此時犯人也發(fā)現(xiàn)了孩子們的計謀開始尋找光彥他們，柯南利用麻醉槍也終于制符了犯人們。

一波未平一波又起，繼越路被人襲擊之后，彌山屋也意外失火，并且有目擊者表示彌山的哥哥曾出現(xiàn)在火災(zāi)現(xiàn)場，案件越來越撲朔迷離，小五郎和警方等人決定先回廣島試圖從紳六的友人著手調(diào)查，沒想到悲劇再次發(fā)生，上諏訪被不明人士襲擊，這同樣與宮島的七大不可思議相關(guān)，柯南想到了上諏訪曾說的話，而這也正是破案的關(guān)鍵，沒想到兇手居然是擁有最有力不在場證明的那個人！

在警方對三名嫌疑人進行偵訊時，他們?nèi)朔炊嗷ブ肛?zé)并揭露對方的犯案動機，這時，有人在更衣室內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一個空瓶子，另外在湖面上還有漂浮的火柴棒，為了弄清真相，警方又找來工作人員進行對峙，然而，他們卻表示并未發(fā)現(xiàn)異樣，期間，女主演深汐的一句話點醒了柯南，在他的引導(dǎo)下，大家得知一整夜都呆在溫泉里的人并不是兇手而是死者本人，那么，兇手到底是誰？在他的身上又有怎樣的關(guān)鍵性證據(jù)？