為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來(lái)到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個(gè)小女孩在一起，同時(shí)照片上還出現(xiàn)了一個(gè)行蹤可疑的男人。這時(shí)，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來(lái)找一個(gè)叫陽(yáng)菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個(gè)孩子。據(jù)陽(yáng)菜的父親周平所說(shuō)，在陽(yáng)菜失蹤的同時(shí)他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進(jìn)行尋找時(shí)，陽(yáng)菜和小蘭遇到了危險(xiǎn)。

就在萬(wàn)由美好不容易找到自己的身份的時(shí)候卻突然逃走了，而她遺失的紙條上寫(xiě)著“要知道真相就一個(gè)人來(lái)”的信息！而就在柯南追過(guò)來(lái)之后發(fā)現(xiàn)險(xiǎn)遭毒手的萬(wàn)由美。在眾人調(diào)查神社時(shí)得知萬(wàn)由美之前曾來(lái)過(guò)這里。晚上萬(wàn)由美又再次的險(xiǎn)遭綁架，但凡人卻留下了一份借條，借此柯南推斷出了犯人的身份，而所謂的好友的身份也最終暴露出來(lái)。

少年偵探團(tuán)與白鳥(niǎo)警官在電影院偶遇，期間，他回想起了自己想要成為警官的理由，這時(shí)，一名叫笠倉(cāng)那海的小姐與大家相識(shí)，并且她與白鳥(niǎo)警官曾經(jīng)相識(shí)過(guò)女孩一樣，會(huì)用吸管包裝紙做成的花帶裝飾樂(lè)杯，難道她就是白鳥(niǎo)回憶中的少女？在聽(tīng)說(shuō)那海被跟蹤狂騷擾之后 ，大家一起前往她現(xiàn)居住的公寓 卻在發(fā)現(xiàn)她的男友橫尸家中，這是跟蹤狂犯下的命案嗎？還是這根本就是那海的自導(dǎo)自演？

警方在將這三個(gè)嫌疑人分開(kāi)偵訊之后，又在死者的包里發(fā)現(xiàn)了一把手槍和強(qiáng)盜集團(tuán)百鬼夜行留下的字條，并從小島權(quán)作的秘書(shū)那里得知，他舉辦此次活動(dòng)是為了尋找殺死自己愛(ài)犬的同叫小島的強(qiáng)盜頭目，于是柯南利用與死者相同的方法找出兇手，雖然證據(jù)被銷(xiāo)毀，但他巧施妙計(jì)讓兇手自己主動(dòng)承認(rèn)了罪行。

這天作為地區(qū)體驗(yàn)采訪的嘉賓，小蘭和柯南來(lái)到了岡山。在參觀美術(shù)館的時(shí)候遇到失去記憶的奇怪女人，而在經(jīng)過(guò)檢查后發(fā)現(xiàn)身上還有扭打的痕跡。而趕來(lái)小五郎接受了調(diào)查她過(guò)去的委托。通過(guò)她畫(huà)的畫(huà)小蘭她們開(kāi)始尋找她的記憶，而就在這時(shí)柯南發(fā)現(xiàn)她們被跟蹤了。在來(lái)到野崎家的大宅之時(shí)出現(xiàn)了認(rèn)識(shí)她的人而她的名字是吉瀨萬(wàn)由美，找回名字的萬(wàn)由美卻突然逃走了！