少年偵探隊(duì)放學(xué)去游戲軟體公司詢問第二天新游戲發(fā)售的事情，沒想到元太因?yàn)橹毕肷蠋鴽_進(jìn)了董事長的辦公室，慌亂之中還拿走了新游戲的碟片，這讓董事長很是緊張，因?yàn)榈锸撬麣⑷说挠跋瘢履吓銮煽吹蕉麻L追元太等人的時(shí)候身上帶了手槍，意識(shí)到元太他們有危險(xiǎn)，便在董事長身上裝了竊聽器，他聽到董事長讓一個(gè)叫BEE的人追殺元太，這個(gè)BEE到底是誰？元太他們又能否成功脫險(xiǎn)？

按照慣例，家里如果有人死去就要演奏安魂曲，于是，羽賀開始了他的演奏，就在大家沉浸于琴聲之中時(shí)，蓮希的奶奶突然從樓上墜落，警方在案發(fā)的房間里發(fā)現(xiàn)了被摔壞的仿品斯托拉地巴力毆斯以及窗邊的椅子，于是認(rèn)為，蓮希奶奶很有可能是自殺，但是一夜之間發(fā)生兩起命案，并且死者都是在密室中死亡，難道是小提琴的詛咒再次應(yīng)驗(yàn)？

柯南和光彥等人在放學(xué)的路上遇到了警察辦案，詢問得知，一個(gè)叫江上的婆婆被自己家陽臺(tái)的花盆意外砸死，鄰居們都把江上稱為“烏鴉婆婆”，她曾偶然在垃圾堆里翻出中獎(jiǎng)券，于是便常常去翻垃圾窺探鄰居的隱私，而招致大家的反感，就在警方想以意外事件結(jié)案時(shí)，柯南察覺到從樓頂?shù)粝聛淼幕ㄅ韬芷婀郑?jīng)過調(diào)查，他認(rèn)定這是一起蓄意殺人事件。

為了謹(jǐn)慎起見，佐藤拜托目暮警官分別派人監(jiān)視這三個(gè)可疑人士，就在大家擔(dān)心浩太，而不知如何是好時(shí)，浩太居然從外面回來了，看著平安無事的浩太，大伙兒懸著心終于放下了，可是人質(zhì)雖然回來，還是不知道犯人是誰，佐藤主張一查到底，可將史卻不愿再追究下去，這時(shí)，高木警官注意到了腳底濕漉漉的浩太，詢問之后，他便一人沖了出去……

13年前，發(fā)生過的國友淳大的沉船海難事件和公館全體工作人員的家屬死亡事件漸漸的浮上水面。柯南認(rèn)為有恐高癥的波花不會(huì)接近關(guān)口被殺的3層的陽臺(tái)，所以很難行兇。同樣茂子，綿引，赤冢也有奇怪的習(xí)慣和病癥，都不太可能是殺害關(guān)口的犯人。而在藥瓶上檢測出來的未知的指紋更使兇手的身份疑團(tuán)加深，但是在柯南的推理下最終確定了兇手的身份。