阿笠博士帶著少年偵探團(tuán)到深山里挖竹筍的時(shí)候，車(chē)子突然出現(xiàn)故障，柯南等人被迫留在深山之中。為了避雨而來(lái)到這里別墅區(qū)的少年偵探團(tuán)被一陣鋼琴聲所吸引，于是，大伙兒進(jìn)入這棟別墅，雖然這里有人生活的痕跡卻沒(méi)有看到半個(gè)人影，而且留在現(xiàn)場(chǎng)的日記還寫(xiě)著可怕的內(nèi)容，之后大家決定找出日記中出現(xiàn)的被綁架男孩，這時(shí)，屋內(nèi)突然停電，伴隨著少年偵探團(tuán)的恐慌鋼琴聲再次響起。

柯南用變聲領(lǐng)結(jié)將其中一名搶匪引到廁所并和大家一起將他制服，根據(jù)茱蒂老師提供的線索即搶匪注重時(shí)間以及讓認(rèn)識(shí)的人互相捆綁這兩點(diǎn)，柯南推斷出了搶匪的目的以及他們的逃跑計(jì)劃，于是，少年偵探團(tuán)在柯南的指揮下相互配合，爭(zhēng)分奪秒的把即將爆炸的炸彈送進(jìn)電梯里，之后，柯南又將計(jì)就計(jì)把混在人質(zhì)中剩下的三名人質(zhì)揪了出來(lái)，本以為一切就此結(jié)束，沒(méi)想到……

就在光彥撥通報(bào)警電話之時(shí)，檢查的工人以小哀作為威脅，沒(méi)有辦法下光彥掛斷了求救電話。犯人們商議著要放棄贖金處理掉一切，少年偵探團(tuán)的各位陷入了危機(jī)，就在這時(shí)步美注意到柯南發(fā)出的信號(hào)，按照指示給依次給步美，柯南，元太和阿笠博士的手機(jī)打電話來(lái)分散犯人的注意力，但因?yàn)槁曇籼蠓炊l(fā)了犯人的注意。而此時(shí)犯人也發(fā)現(xiàn)了孩子們的計(jì)謀開(kāi)始尋找光彥他們，柯南利用麻醉槍也終于制符了犯人們。

柯南和小蘭在東都環(huán)狀線列車(chē)上遇見(jiàn)了一位見(jiàn)義勇為的老人，然而，沒(méi)想到當(dāng)他們?cè)俅我?jiàn)面時(shí)卻是在殺人現(xiàn)場(chǎng)，死者是詐騙集團(tuán)的通緝犯，而這位名叫法月的老人正是此案的目擊證人，他說(shuō)自己曾看到同是詐騙犯的桐谷出沒(méi)案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)，但桐谷卻大喊冤屈，期間，柯南察覺(jué)到老先生法月的證詞有疑點(diǎn)，深入調(diào)查后，真相果然如他料想一般。

小五郎受東山先生之邀來(lái)到獵戶座企劃公司，沒(méi)想到在這里打電話聯(lián)系東山先生的時(shí)候，竟然看到窗外有人墜樓而亡，警方立刻介入調(diào)查，死者名叫高幡，同是這家公司的職員，而當(dāng)時(shí)在公司的只有東山和另一名職員砂川七惠，但東山卻有充分的不在場(chǎng)證明。之后，隨警方來(lái)到高幡辦公室的柯南在這里發(fā)現(xiàn)了一些關(guān)鍵線索，即使案件多么錯(cuò)綜復(fù)雜但真相只有一個(gè)！