毛利小五郎受久須美工械廠社長(zhǎng)的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對(duì)職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對(duì)象，三人計(jì)劃在倉(cāng)庫(kù)抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。

唐三為小舞梳頭，不由地聊起了各自的家庭，兩個(gè)人越聊越投機(jī)，小舞高高興興去吃飯，王圣等人趕忙湊過(guò)來(lái)好奇地問(wèn)東問(wèn)西，唐三心里坦蕩蕩，他夸小舞是一個(gè)很單純的姑娘。蕭塵宇派柳龍?jiān)谂鷮嬍艺伊艘淮笕Γ膊灰?jiàn)小舞的人影，沒(méi)想到小舞竟然住在七舍，而且還是這里的老大，蕭塵宇大為惱火。小舞興沖沖拉著唐三去食堂吃飯，蕭塵宇邀請(qǐng)小舞去魂師會(huì)館吃好吃的，小舞根本不領(lǐng)情，柳龍沖小舞大呼小叫，要強(qiáng)行拉她走，小舞飛起一腳把柳龍打翻在地，蕭塵宇惱羞成怒，還搬出苑長(zhǎng)是他三叔來(lái)說(shuō)事，唐三根本不買賬，拉起小舞就去食堂吃飯了。理論課考試的時(shí)候，柳龍不會(huì)答題，就搶了王圣的卷子，還倒打一耙，誣陷王圣作弊，唐三和小舞站出來(lái)揭穿柳龍，監(jiān)考老師不容分說(shuō)把柳龍和王圣趕出去。接下來(lái)就是武魂格斗課，教官讓蕭塵宇給同學(xué)們做示范，蕭塵宇讓唐三做他的搭檔，其實(shí)就是想讓唐三當(dāng)活靶子，趁此機(jī)會(huì)好好教訓(xùn)唐三，蕭塵宇揮拳擊打唐三胸口，他被打得站立不穩(wěn)差點(diǎn)摔倒，蕭塵宇步步緊逼，招招致命，一一被唐三巧妙化解，兩個(gè)學(xué)員分別死死拉住唐三的手臂，蕭塵宇揮拳狠狠打向他的腹部，唐三紋絲不動(dòng)，蕭塵宇感覺(jué)有一股巨大的反擊力量，十分驚訝唐三如何反擊的。教官讓學(xué)員們擊打沙袋練

若狹老師不慎將話劇演出要用的屏風(fēng)弄臟，柯南一行跟著若狹老師回到公寓幫忙重畫(huà)，完工后隔壁房間傳來(lái)了噪音，元太和柯南前去抗議時(shí)遇到了新的案件。死者是一名模特，而她的男友是有名的高爾夫運(yùn)動(dòng)員，若狹老師在早上聽(tīng)到了兩人的爭(zhēng)吵，而柯南已經(jīng)確定了誰(shuí)是兇手，現(xiàn)在只差找到關(guān)鍵的證據(jù)。

17年前日本將棋四冠王羽田浩司遇襲案讓柯南非常在意，和他同日遇害的還有同一酒店的美國(guó)資本家阿曼達(dá)，柯南和灰原推測(cè)這是組織所為，但羽田浩司遇害時(shí)的房間卻不像是組織的一貫風(fēng)格。地產(chǎn)公司社長(zhǎng)被害時(shí)手里拿著阿笠博士發(fā)明的剪刀，目暮警官請(qǐng)阿笠博士來(lái)說(shuō)明剪刀的用途看是否能為破案提供幫助，柯南注意到這次的案件卻與17年前羽田浩司遇害案非常相似。

小五郎讓柯南和小蘭陪他一起去位于大分的別府溫泉旅行，說(shuō)到別府溫泉最有名的莫過(guò)于地獄巡游之旅，就在小蘭和柯南興致勃勃討論的時(shí)候小五郎卻在一旁默不作聲。在柯南和小蘭的逼問(wèn)下小五郎才說(shuō)出了實(shí)情，這次的旅行目的是尋找仲代電氣社長(zhǎng)的女兒麻奈美，柯南根據(jù)照片找到了麻奈美所住的旅館，但這僅僅只是開(kāi)始。