終于到了正式盜取“藍色奇跡”這一天，鈴木博物館附近被人圍的水泄不通，而且次郎吉也加派了更多的直升機，柯南在樓頂?shù)却鲁霈F(xiàn)的時候發(fā)現(xiàn)樓上有兩道新的刮痕，這時，基德如約而至，雖然突降大雨但這絲毫沒有造成任何影響，看著基德一步步接近寶石，次郎吉卻淡定的說自己早有防備，他到底有何計劃？基德能否成功盜取寶石并順利脫身？柯南又會有什么樣的行動？

正當小蘭她們陷入困境的時候新一卻打來了電話，小蘭在電話里說明了現(xiàn)場的情況并指出有三個奇怪的客人借用過便利店的廁所。但是，貨物不見的那天，按規(guī)定只有七川值班。在新一的引導下小蘭確定了犯人的身份，并按照新一的提示找出了犯人。而店長以償還偷盜物品為由留下了陷入困境的犯人。七川也洗清了嫌疑。

出席熊本網(wǎng)球大會的柯南他們，大會當日小蘭被誘拐。柯南回想小蘭電話中內(nèi)容判斷出小蘭現(xiàn)在咋橫濱并在獲悉園子所拾到的手機中接收到的兩條短信的內(nèi)容后，知道內(nèi)容來自倉庫。在救出小蘭之后眾人發(fā)現(xiàn)立川的目的。頒獎典禮上立川果然當中刺殺成增先生。在來苑子的說服下，最終立川放下手中的刀，放棄了這種極端的復仇之路。

在電梯邊被殺的中條寫下暗號『○×△』。還有一個文字是在殺害現(xiàn)場的電梯踏板邊的『□』?？履蠌挠⒄Z老師朱蒂的話中得到啟發(fā)，在調(diào)查死者的工作場所之后發(fā)現(xiàn)碎紙機的存在從而推理出死亡信息的真實意義。原來死亡信息很像是文字的部分，像記號般的文字。而在對照目暮警官拿著嫌疑犯的名單之后很快找到了兇手！

解決了橫濱中華街的命案之后，小蘭突然倒地不起，在發(fā)高燒的情況下想起過去碰到的命案。那是與新一去紐約時發(fā)生的事情，有希子帶他們兩人一起去看話劇，在劇場門口與明星莎朗匯合后，大家一起去參觀開演前的舞臺陳設(shè)，不想這時卻發(fā)生了意外，盔甲服裝從天花板上墜落，而其中一名女演員卻無法躲避，危機時刻，小蘭挺身而出。