乾隆拜祭顏驥，碰到女扮男裝的如玉。乾隆對如玉的見解產生興趣。這時殺手趕到，乾隆挺身相救，并帶如玉從樓上一躍而下逃脫了追殺。紀曉嵐想到往年和珅都請自己給太后寫祝壽賦，于是想借此來向和珅交換煙桿。誰知和珅拿出戴沾的祝壽賦來賣弄，紀曉嵐仔細看過后指出賦中暗藏對太后不敬之辭，和珅氣急敗壞。御醫為如玉療傷，卻發現如玉實為女兒身。得知紀曉嵐將賦中暗語告訴和珅，戴沾痛斥紀曉嵐。紀曉嵐苦口婆心規勸戴沾不要因一時沖動而葬送終生，兩人盡釋前嫌。乾隆下旨除去紀曉嵐《四庫全書》總纂官的職務，和珅幸災樂禍。如玉醒來得知乾隆身份大驚。乾隆佯裝不知如玉為女兒身，邀其共眠，如玉百般推辭。乾隆裝睡，如玉想到乾隆賜死全家，欲殺乾隆報仇，但想到自己為乾隆所救又不忍下手，痛苦之時想一死了之，被乾隆攔下。乾隆心下斷定如玉與顏驥有關。和珅指使同為編纂官的馮大人到獄中探望戴沾，馮慌稱要把戴沾的手稿編纂成冊，卻暗中將手稿交給了和珅，以換取自己落在和珅手中的罪證。乾隆帶如玉前往四庫館。如玉盡顯才學，被乾隆指派到四庫館修書。

紀曉嵐不肯循親枉法，力數薛大老板之罪狀，皇上無言以對，和巧言令色，深通馬屁術和離間術，莫愁聞知老夫人既是貪案的罪魁禍首，想到為此犧牲的黃克明，舉劍直指老夫人，并慷慨陳詞，欲報仇血恨，皇上深為震驚，迫于情勢，決定親自出馬，弄清案情，查明真相。 紀曉嵐與和天生一對冤家對頭，一旦相見，便免不了冷嘲熱諷。和建議以無關緊要的人物做替罪羊洗清柳志夫人的污點，紀曉嵐豈相從，柳志夫人痛訴多年來失子之痛，才為彌補失落感，用金錢報仇世人。皇上矛盾不已，紀曉嵐毫不手軟，斷然判案，不惜身家性命。柳志夫人自知罪孽重，不忍再為難皇上毅然服毒自盡。 一日，紫禁城內，君臣又聚在一起，為奶娘命案一事產生歧義，和深知此案頗多詭異，不愿輕易牽掛上身，紀曉崗卻明察秋毫，知此中大有文章，正欲深入調查，御醫呂長安卻越獄逃跑。

經過一番教訓，和確實學乖了，不僅對金大爺俯首帖耳，對小月、莫愁亦小心翼翼，紀曉嵐剛剛抵達王廷贊的別院，他又滿臉是笑地表示歡迎，事出意外，紀曉嵐不知他是何居心，反倒不便立刻搜查藏在其間的帳本。 為擺脫和的瞎摻和，與紀曉嵐一見如故的金大爺設計誘和返回軍營，豈料和并非省油燈，胡攪蠻纏，一心要撈些便宜。負隅頑抗的王旦望將之視為突破口，不惜以百萬銀票和義女作為禮物收買和，和向來見錢眼開，憚于紀曉嵐的精明犀利，未敢輕舉妄動。 從帳本上看，根本找不到一絲一毫王旦望涉案的證據，而王廷贊亦只肯交代一些無關緊要的小官小吏，語多躊躇，紀曉嵐苦心意旨，向其點明利害。 王旦望氣急敗壞，雇兇刺殺紀曉嵐。殺手聞知眼前之人乃當今第一才子，加之其身上又佩帶著一個特殊的荷包，便慨然將他放走。

劉構在和珅的指示下誣蔑紀曉嵐砥毀佛法。乾隆巧妙地處理此事，讓劉構碰了釘子。得知賈貴妃的兄弟賈三要砸戲班子，和珅計上心來。賈三以此戲誣蔑自己祖先賈似道為名率眾滋事，并到都察院告狀，和珅鼓動乾隆一看究竟。賈三自報家門，很是不可一世。紀曉嵐施妙計，使賈三當眾出丑卻又啞口無言。乾隆對紀曉嵐的巧妙布局頗為欣賞。和珅的本家貴寧為了攀龍附鳳，托和珅將妹妹小芳假冒滿人送進宮中應選秀女。小芳大鬧順貞門，坦言自己身為漢人不能入選。乾隆喜愛其嬌美容貌而特準其應選，但小芳誓死不入宮。太監自作主張將她囚禁起來。小芳的姐夫海升懇請紀曉嵐出面救出小芳。得知小芳的境遇，乾隆大怒。海升指責妻子紐氏為了貪圖權勢，縱容弟弟貴寧將小芳送去選秀，紐氏卻對海升不屑一顧，只顧練法。自從撞到小月，賈三開始魂不守舍。貴寧為了巴結賈三，提出將小芳獻給賈三。海升巡街之時，正遇上和珅的下人駕著馬車在街上橫沖直撞，就在快要撞向行人時，男裝的小月出現并止住馬車。

了凡記錄下來的涉及徇私舞弊的人員名單顯示敏德正是首貪。看到確鑿證據，乾隆下令抓捕敏德。收到和珅的消息，敏德連夜逃走。紀曉嵐建議乾隆從嚴查處涉案人員以警示世人，并重新閱卷以示公正。趙新進看到自己榜上有名，欣喜不已。敏德借和珅之名要見紀曉嵐，紀曉嵐不知有詐，被敏德襲擊。關鍵時刻，趙青救了紀曉嵐一命，自己卻受傷。乾隆下令斬首敏德，并決定重開恩科。和珅依然擔任主考官。紀曉嵐帶小月去專賣應考用具的“連升店”，看到無奇不有的作弊工具，還有一間名為“獨占鰲頭”的書院。